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Caractérisation de déterminants de l'immunité naturelle du blé tendre adaptés à des scénarios climatiques de rupture // Characterization of Determinants of Natural Immunity Adapted to Disruptive Climatic Scenarios in Bread Wheat

ABG-122157
ADUM-55139
Sujet de Thèse
03/04/2024 Contrat doctoral
Université Clermont Auvergne
AUBIERE - France
Caractérisation de déterminants de l'immunité naturelle du blé tendre adaptés à des scénarios climatiques de rupture // Characterization of Determinants of Natural Immunity Adapted to Disruptive Climatic Scenarios in Bread Wheat
Multistress / Stress combinés, Blé, Phytopathologie, Physiologie moléculaire, Microbiologie
Multistress / Combined stress, Bread wheat, Phytopathology, Molecular physiology, Microbiology

Description du sujet

UMR GDEC 1095 Génétique, Diversité et Écophysiologie des Céréales, UCA/INRAE

Directeur de thèse: Ludovic Bonhomme (PU-HDR) ludovic.bonhomme@uca.fr


Caractérisation de déterminants de l'immunité naturelle du blé tendre adaptés à des scénarios climatiques de rupture

Les fluctuations environnementales ponctuelles extrêmes caractérisant l'évolution du climat vont profondément remodeler les interactions plantes/pathogènes avec des conséquences majeures sur l'évolution des cortèges de parasites et sur l'expression de l'immunité des céréales. Comprendre leurs conséquences devient aujourd'hui un objectif prioritaire pour identifier des sources de résistance efficaces adaptées à des scénarios climatiques extrêmes et nécessite de les analyser en prenant en compte l'évolution probable des pools génétiques que le changement climatique impliquera tant chez l'agent pathogène que chez les cultivars. Basé sur l'interaction modèle blé tendre/Fusarium graminearum, responsable de la fusariose de l'épi, le projet a un double objectif : d'une part, identifier des ressources génétiques de l'hôte et de son pathogène disposant de traits physiologiques compatibles avec des scénarios climatiques futurs et, d'autre part, caractériser les déterminants génétiques, moléculaires et physiologiques, contrôlant leur interaction avec F. graminearum dans des scénarios climatiques de rupture. Ce travail interdisciplinaire entre microbiologie et phytopathologie bénéficiera de la complémentarité d'une collaboration étroite avec l'UMR MycSA de Bordeaux.

Rocher et al. (2024). Integrative systems biology of wheat susceptibility to F. graminearum uncovers a conserved gene regulatory network and identifies master regulators targeted by fungal core effectors. BMC Biology 22:53.
Adamik et al. (2023). A generic part of specific combined responses to biotic and abiotic stresses in crops: Overcoming multifaceted challenges towards new opportunities. Frontiers in Plant Science 14:1140808
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UMR GDEC 1095 Genetics, Diversity, and Ecophysiology of Cereals, UCA/INRAE

Thesis Supervisor: Ludovic Bonhomme (PU-HDR) ludovic.bonhomme@uca.fr

Characterization of Determinants of Natural Immunity Adapted to Disruptive Climatic Scenarios in Bread Wheat

The extreme environmental fluctuations that characterize climate change will profoundly reshape plant/pathogen interactions, significantly impacting the evolution of parasite communities and the expression of cereal immunity mechanisms. Understanding their consequences has become a primary objective to identify effective and climate-adapted resistance sources in the face of extreme climatic scenarios while considering the likely evolution of genetic pools, both in the pathogen and in wheat cultivars. Based on the model of the interaction between the bead wheat and Fusarium graminearum, the causal agent of the Fusarium head blight disease, this project aims to, on one hand, select genetic resources from the host and its pathogen with physiological traits compatible with future climate scenarios. On the other hand, it aims to characterize the molecular determinants of their interaction in bold disruptive climate scenarios that allow anticipating environmental fluctuations still largely underestimated. This interdisciplinary work bridging microbiology and phytopathology will benefit from the complementary collaboration with the MycSA INRAE Research Unit in Bordeaux.

Rocher et al. (2024). Integrative systems biology of wheat susceptibility to Fusarium graminearum uncovers a conserved gene regulatory network and identifies master regulators targeted by fungal core effectors. BMC Biology 22:53.
Adamik et al. (2023). A generic part of specific combined responses to biotic and abiotic stresses in crops: Overcoming multifaceted challenges towards new opportunities. Frontiers in Plant Science 14:1140808
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Début de la thèse : 01/10/2024

Nature du financement

Contrat doctoral

Précisions sur le financement

Concours pour un contrat doctoral

Présentation établissement et labo d'accueil

Université Clermont Auvergne

Etablissement délivrant le doctorat

Université Clermont Auvergne

Ecole doctorale

65 Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement

Profil du candidat

Master 2 en Biologie Végétale ou équivalent Expérience en expérimentation végétale souhaitée, connaissances solides en phytopathologie et microbiologie Bonnes compétences en analyse de données complexes ainsi qu'en statistiques
Master's degree in Plant Biology or equivalent Experience in plant experimentation desirable, solid knowledge in phytopathology and microbiology. Good skills in complex data analysis and statistics.
30/06/2024
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