Amélioration de la recanalisation de l'AVC ischémique grâce aux approches multiOMICS // Improving ischemic stroke recanalization with multiomics

Chaque année, 11,9 millions de personnes dans le monde sont victimes d'un AVC, dont un tiers décède et un autre tiers reste handicapé. Les AVC représentent la deuxième cause de décès et d'incapacité. En raison du vieillissement de la population, leur fréquence devrait augmenter. Les AVC ischémiques, causés par des caillots sanguins, représentent 87 % des cas. Les traitements visent à rétablir rapidement la circulation, par thrombolyse ou thrombectomie mécanique. Toutefois, le phénomène de 'no-reflow', où la circulation ne reprend pas malgré la prise en charge du caillot, constitue un défi majeur pour la récupération après un AVC et les résultats à long terme pour les patients. Ce projet vise à identifier des biomarqueurs associés au phénomène de no-reflow dans une cohorte de patients ayant subi un AVC ischémique, en utilisant des approches multiomiques, et à mieux comprendre la physiopathologie du no-reflow dans un modèle animal selon 3 axes: 1) Analyse multiomic des AVC ischémiques, incluant protéomique, immunophénotypage des leucocytes circulants par cytométrie spectrale et RNA sequencing, 2) Évaluer la relation entre les signatures multiomiques et les résultats d'IRM pour identifier des biomarqueurs prédictifs du phénomène de 'no-reflow', 3) Utiliser un modèle animal d'AVC/recanalisation/no-reflow pour étudier les mécanismes sous-jacents, avec transcriptomique spatiale, histologie, immunohistochimie et microscopie confocale pour identifier des cibles thérapeutiques.
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Every year, 11.9 million people worldwide suffer from a stroke, one-third of whom die, and another third are left with disabilities. Strokes are the second leading cause of death and disability. Due to the aging population, their frequency is expected to increase. Ischemic strokes, caused by blood clots, account for 87% of cases. Treatments aim to restore circulation quickly, either through thrombolysis or mechanical thrombectomy. However, the phenomenon of 'no-reflow,' where circulation does not resume despite the clot being managed, presents a major challenge for recovery after a stroke and long-term outcomes for patients. This project aims to identify biomarkers associated with the no-reflow phenomenon in a cohort of patients who have experienced an ischemic stroke, using multi-omics approaches, and to better understand the pathophysiology of no-reflow in an animal model through 3 main axes: 1) Multi-omic analysis of ischemic strokes, including proteomics, immune profiling of circulating leukocytes by spectral cytometry, and RNA sequencing, 2) Assess the relationship between multi-omic signatures and MRI outcomes to identify predictive biomarkers for the 'no-reflow' phenomenon, 3) Use an animal model of stroke/recanalization/no-reflow to study underlying mechanisms, with spatial transcriptomics, histology, immunohistochemistry, and confocal microscopy to identify therapeutic targets.
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Début de la thèse : 01/10/2025

Contrat doctoral

Concours pour un contrat doctoral

Université de Lille

446 Biologie Santé de Lille

Nous recherchons un étudiant motivé par la recherche translationnelle dans le domaine des maladies cardiovasculaires. Le candidat devrait avoir un intérêt marqué pour la biologie vasculaire, la médecine de précision et la bioinformatique. Qualifications requises : Formation en sciences de la vie, en ingénierie biomédicale, en médecine ou dans un domaine connexe. Solides compétences en biologie moléculaire, production et analyses de données OMICs, des notions en hémostase et en bioinformatique sont un plus. Connaissance des principes de base de la pathophysiologie cardiovasculaire, en particulier des AVC. Capacité à travailler de manière autonome et en équipe, avec de bonnes compétences en communication. Capacité à concevoir et à mener des expériences de manière rigoureuse, mais aussi à suivre les protocoles établis. Analyse critique des résultats obtenus. Maîtrise avancée de l'anglais écrit et parlé
We are looking for a motivated student interested in translational research in the field of cardiovascular diseases. The candidate should have a strong interest in vascular biology, precision medicine, and bioinformatics. Required Qualifications: Background in life sciences, biomedical engineering, medicine, or a related field. Strong skills in molecular biology, OMICs data production and analysis; knowledge of hemostasis and bioinformatics is a plus. Understanding of the fundamental principles of cardiovascular pathophysiology, particularly stroke. Ability to work both independently and within a team, with strong communication skills. Capacity to design and conduct experiments rigorously while following established protocols. Critical analysis of obtained results. Advanced proficiency in written and spoken English.