DÉVELOPPEMENT ET EVOLUTION DES VOIES VISUELLES // DEVELOPMENT AND EVOLUTION OF VISUAL PROJECTIONS
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ABG-129441
ADUM-62192 |
Sujet de Thèse | |
| 13/03/2025 | Contrat doctoral |
Sorbonne Université SIM (Sciences, Ingénierie, Médecine)
Paris - France
DÉVELOPPEMENT ET EVOLUTION DES VOIES VISUELLES // DEVELOPMENT AND EVOLUTION OF VISUAL PROJECTIONS
- Biologie
Retine, Evolution, Vision en 3D, guidage axonal, poissons, organoides
retina, Evolution, 3D Vision, Axon guidance, Fish, Organoids
retina, Evolution, 3D Vision, Axon guidance, Fish, Organoids
Description du sujet
Bien que l'organisation cellulaire de la rétine humaine, ait été étudiée depuis de nombreuses années, on connait peu les premières étapes de son développement et à quel point elles sont conservées chez les vertébrés. Ainsi, on ignore encore combien de types dec ellules rétiniennes distinctes existent chez l'homme et comment elles sont générées à partir d'un pool commun de progéniteurs.L'objectif du projet est d'étudier le développement et l'évolution de la rétine et de développer de nouveaux modèles in vitro pour étudier le développement du système visuel. Dans ce projet, nous proposons de cartographier et de caractériser les types de cellules rétiniennes au cours du développement. Pour atteindre cet objectif, nous établirons le profil des rétines embryonnaires/foetales dans diverses espèces de vertébrés et nous effectuerons des analyses ATACseq pour étudier les réseaux de régulation génique en jeu au cours de la rétinogenèse. Nous cartographierons la position des types de cellules rétiniennes dans la rétine en développement en utilisant des techniques d'imagerie 3D de pointe. Ces informations sont essentielles pour comprendre l'étiologie de diverses maladies oculaires d'origine développementale, y compris l'albinisme. En outre, nous utiliserons des explants de rétine ainsi que des neurones rétiniens et des organoïdes dérivés d'iPS pour valider la fonction de gènes candidats afin d'étudier les mécanismes moléculaires contrôlant la latéralité des projections visuelles.
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Despite our knowledge of the cellular organization in the human retina, in depth profiling of human cell lineages from the earliest stages of retinogenesis are only recently beginning to be studied. How many distinct retinal cell types exist in human and how they are generated from a common pool of progenitors is still unknown. The aim of the project is to study the development and evolution of the retina and to develop new in vitro models to study visual system development. In this project, we propose to map and characterize retinal cell types across development. To achieve this goal, we will profile embryonic/fetal retinas in various vertebrate species andperform ATACseq to study gene regulatory networks at play during retinogenesis. We will map the position of retinal cell types in the developing retina using cutting edge 3D imaging techniques. This information is essential for understanding the etiology of various eyediseases of developmental origin, including albinism. In addition, we will use retina explants as well as h iPS-derived retinal neurons andorganoids to validate the function of candidate genes to study the molecular mechanisms controlling the laterality of visual projections.
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Début de la thèse : 01/10/2025
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Despite our knowledge of the cellular organization in the human retina, in depth profiling of human cell lineages from the earliest stages of retinogenesis are only recently beginning to be studied. How many distinct retinal cell types exist in human and how they are generated from a common pool of progenitors is still unknown. The aim of the project is to study the development and evolution of the retina and to develop new in vitro models to study visual system development. In this project, we propose to map and characterize retinal cell types across development. To achieve this goal, we will profile embryonic/fetal retinas in various vertebrate species andperform ATACseq to study gene regulatory networks at play during retinogenesis. We will map the position of retinal cell types in the developing retina using cutting edge 3D imaging techniques. This information is essential for understanding the etiology of various eyediseases of developmental origin, including albinism. In addition, we will use retina explants as well as h iPS-derived retinal neurons andorganoids to validate the function of candidate genes to study the molecular mechanisms controlling the laterality of visual projections.
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Début de la thèse : 01/10/2025
Nature du financement
Contrat doctoral
Précisions sur le financement
Concours pour un contrat doctoral
Présentation établissement et labo d'accueil
Sorbonne Université SIM (Sciences, Ingénierie, Médecine)
Etablissement délivrant le doctorat
Sorbonne Université SIM (Sciences, Ingénierie, Médecine)
Ecole doctorale
158 Cerveau, cognition, comportement
Profil du candidat
Etudes et formation en neurosciences ou en biologie du développement
Formation de base en bioinformatique (analyse d'image ou de données de transcriptomiques) ou en culture cellulaire
Connaissances de base en microscopie confocale
Bon niveau en Anglais
Training in Neuroscience or Developmental biology Experience in bioinformatics (image analysis or transcriptomics) or in cell biology Knowledge in confocal microscopy Good level in English
Training in Neuroscience or Developmental biology Experience in bioinformatics (image analysis or transcriptomics) or in cell biology Knowledge in confocal microscopy Good level in English
01/06/2025
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