Rôle du microbiome dans la transmission d'un agent bacterien phytopathogène par insecte vecteur // Role of the microbiome in the transmission of a bacterial plant pathogen by insect vector.

Les maladies transmises par les insectes vecteurs ont des répercussions importantes sur la santé humaine et l'économie. En particulier, les maladies végétales transmises par des vecteurs ont des impacts écologiques et économiques importants. Les moyens de contrôle traditionnels (c'est-à-dire les pesticides) ne sont pas durables et perdent en efficacité en raison de l'émergence de populations d'insectes résistants. Il est nécessaire de développer des stratégies plus respectueuses de l'environnement et durables. Cela est particulièrement vrai dans le cas des maladies transmises par les hémiptères et en particulier pour les phytoplasmes et leurs insectes hôtes. Une alternative à l'utilisation de pesticides serait de tirer parti des résidents microbiens des insectes (microbiome). Avant de faire cela, il est essentiel de comprendre comment le microbiome impacte la fitness de son hôte et comment il interagit avec les pathogènes vectorisés.
Dans cette thèse, nous nous concentrerons sur le modèle formé par le phytoplasme responsable de la flavescence dorée de la vigne et ses insectes hôtes : son hôte naturel, Scaphoideus titanus ; et l'hôte modèle de laboratoire, Euscelidius variegatus. Notre objectif sera de décrypter et comprendre les interactions entre le microbiome des insectes et le pathogène bactérien vectorisé. Plus spécifiquement, le projet décrira la diversité microbienne associée à S. titanus et E. variegatus qui n'est pas encore connue. Ensuite, l'effet du phytoplasme sur ces microbiotes sera déterminé. Enfin, les taxons identifiés comme antagonistes potentiels du phytoplasme seront isolés et testés dans une configuration contrôlée pour leur potentiel à interférer avec la transmission du pathogène.
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Insect vector-borne diseases have important repercussions for human health and economy. In particular, vector-borne plant diseases have significant ecological and economic impacts. Traditional means of control (i.e., pesticides) are not sustainable and are losing efficiency due to the emergence of resistant insect populations. There is a need to develop more eco-friendly and sustainable strategies. This is especially true in the case of Hemipteran-transmitted diseases and in particular for phytoplasmas and their insect hosts. One alternative to the use of pesticides would be to take advantage of the microbial residents of insects (microbiome). Before doing that, it is essential to understand how the microbiome impacts the fitness of its host and how it interacts with the vectored pathogens.
In this thesis we will focus on the model formed by the phytoplasma causative of grapevine flavescence dorée and its insect hosts: its natural host, Scaphoideus titanus; and the experimental host, Euscelidius variegatus. Our aim will be to dissect and understand the interactions between the microbiome of insects and the vectored bacterial pathogen. More specifically the project will investigate the microbial diversity associated with S. titanus and E. variegatus which are still not known. Then, study the effect of phytoplasma FD on these microbiotas. Finally, taxa identified as potential antagonists of phytoplasma will be isolated and tested in a controlled setup for their potential to interfere with the transmission of the pathogen.
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Début de la thèse : 01/10/2025

Financement Région/INRA

Université de Bordeaux

154 Sciences de la Vie et de la Santé

* connaissances et pratique de la biologie moléculaire * connaissances et pratique de la microbiologie * connaissances en écologie microbienne * connaissance en entomologie bienvenue * savoir présenter ses résultats à l'oral et à l'écrit en français et anglais
* knowledge in molecular biology * knowledge in microbiology * knowledge in microbial ecology * knowledge in entomology welcome * good oral and writing reporting skills