Comprendre la dynamique de propagation des conidies du champignon responsable de la cercosporiose noire du bananier pour identifier des leviers de gestion agroécologique

La cercosporiose noire du bananier, provoquée par le champignon ascomycète Pseudocercopora fijiensis, est une grave maladie foliaire impactant le rendement de la culture et causant une maturation précoce des fruits. De nombreux traitements fongicides sont effectués pour son contrôle en zone tropicale humide. Cette maladie est arrivée en Martinique en 2010, où une lutte raisonnée par avertissement, reposant sur l’emploi de fongicides systémiques, a été mise en œuvre avec un réel niveau de sobriété au regard des autres zones de production (IFT<10, moins de 1kg de m.a./ha/an). Toutefois, cette lutte raisonnée se heurte à de réelles difficultés, à la fois liées au mode d’application terrestre des traitements et à l’évolution très restrictive de la législation, si bien que les impacts de la maladie font aujourd’hui peser de lourdes menaces sur l’avenir de la filière banane dessert aux Antilles (Risède et al., 2021).

Des approches agroécologiques ont été développées pour limiter les traitements avec en particulier l’effeuillage des zones nécrotiques porteuse d’ascospores (issues de la reproduction sexuée du champignon). Cependant, les conidies issues de la reproduction asexuée du champignon participent aussi à la dissémination de la maladie. Cette thèse a ainsi pour objectif de mieux comprendre et de quantifier la dynamique de propagation de la maladie par ce type de spores, et à identifier de nouveaux leviers pour une gestion agroécologique plus efficace de la maladie. Cette thèse s’insère ainsi dans le cadre du Projet PARSADA « Cercotrop » qui vise à développer de nouveaux leviers de gestion de la cercosporiose noire. Elle sera organisée en trois parties complémentaires :

Le doctorant sera recruté au sein de l’UR GECO du CIRAD (https://ur-geco.cirad.fr). La thèse se déroulera spécifiquement au Cirad en Martinique, au Campus Agro-Environnemental Caraïbe (https://www.caec-carib.org/).  Pour le terrain comme pour la biologie moléculaire, le/la doctorant.e pourra s'appuyer sur les équipes techniques permanentes du CAEC. Le génotypage moléculaire sera réalisé à travers un séjour sur le campus CIRAD de Baillarguet, à Montpellier, au sein de l’UMR PHIM.

Ingénieur.e agronome ou titulaire d’un Master de biologie avec une forte composante en épidémiologie ou pathologie végétale

• Attrait pour la recherche appliquée et le travail expérimental (terrain, laboratoire)
• Bonnes capacités rédactionnelles
• Aptitudes au travail en équipe
• Autonomie, rigueur, sens de l’organisation
• Permis de conduire (catégorie B)