Tolérance au cuivre des levures d'altération du genre Hanseniaspora

Le labo

Vous serez accueilli.e au sein de l’équipe AFIM (Aliment-Fermentation-Interactions-Microbiote) (https://umr-pam.fr/equipe/aliment-fermentation-interaction-microbiote-afim), composante de l’UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques) située sur le campus de l’Université Bourgogne Europe, à Dijon. Notre équipe se consacre à la microbiologie et la qualité des aliments et des produits fermentés et aux interactions microbiote/hôte/environnement. En ce qui concerne les aliments et les boissons fermentées, nous cherchons notamment à mieux maitriser les processus de fermentation pour assurer la qualité organoleptique et sanitaire des produits finis. En particulier, nous travaillons sur la maîtrise de la fermentation alcoolique qui intervient lors de la production du vin.

Le projet (CASDAR CLIMHANS)

L’un des principaux paramètres qui impacte la qualité des vins est la composante microbiologique. Le microbiote, que ce soit celui de la matière première ou celui du produit fermenté est confronté à des perturbations liées à des facteurs climatiques, aux traitements aux champs, à la transformation de la matière première et à l’assainissement des outils de production.

Les levures du genre Hanseniaspora sont généralement les espèces les plus fréquentes et les plus abondantes sur les fruits, et dans les vins lors des premiers jours de fermentation. Les aptitudes de certaines souches de ce genre peuvent avoir, selon les matrices et les conditions fermentaires, un impact positif ou négatif sur la qualité des produits finis. Cependant, malgré leur prédominance dans les boissons fermentées, peu de travaux sont publiés sur le genre Hanseniaspora, que ce soit sur la diversité intra ou inter-espèces et sur son impact en fermentation.

Le projet a comme premier objectif d’évaluer la diversité génétique et phénotypique des espèces et souches de Hanseniaspora présentes en s’appuiant sur les souchotèques des différents partenaires. Puis le second objectif permettra d’évaluer le comportement de certaines souches du genre Hanseniaspora sur des matrices représentatives de celles d’un contexte de production futur (augmentation de la teneur en sucres et de la température des matières premières, diminution de l’acidité totale…) afin d’étudier l’impact du changement climatique sur le métabolisme des levures et sur leur capacité d’adaptation.

Le phénotypage des souches de la collection de travail se fera avec différentes approches notamment pour évaluer leur comportement vis à vis des pratiques culturales (stress cuivre). Ainsi des analyses en milieux liquides seront effectuées en microplaque pour tester la résistance au cuivre, comme publié précédemment par l’UMR PAM, sur un set réduit d’une cinquantaine de souches dont les phénotypes seront les plus contrastés.

Le labo

Vous serez accueilli.e au sein de l’équipe AFIM (Aliment-Fermentation-Interactions-Microbiote) (https://umr-pam.fr/equipe/aliment-fermentation-interaction-microbiote-afim), composante de l’UMR PAM (Procédés Alimentaires et Microbiologiques) située sur le campus de l’Université Bourgogne Europe, à Dijon. Notre équipe se consacre à la microbiologie et la qualité des aliments et des produits fermentés et aux interactions microbiote/hôte/environnement. En ce qui concerne les aliments et les boissons fermentées, nous cherchons notamment à mieux maitriser les processus de fermentation pour assurer la qualité organoleptique et sanitaire des produits finis. En particulier, nous travaillons sur la maîtrise de la fermentation alcoolique qui intervient lors de la production du vin.

Les missions

Etude de la dynamique de croissance en milieu liquide de 50 souches sélectionnées dans le cadre du projet ClimHans.

Caractérisation de la tolérance au cuivre de ces 50 souches en milieu liquide.

Microbiologie pasteurienne, physiologie microbienne, analyses de résultats, mise en forme, traitement de données et valorisation

Le/La candidat(e) devra présenter des compétences en microbiologie et plus particulièrement des levures, mais également en statistique et bioinformatique. La rigueur et l’autonomie seront également attendu. Une connaissance de la filière viti-vinicole serait un plus

Modalités de candidature

Les candidatures (CV et lettre de motivation) sont à transmettre à Sandrine Rousseaux et Géraldine Klein.

- Début du stage : Janvier 2026
- Durée : 6 mois.
- Date limite de candidature : mi-décembre

Les missions

Etude de la dynamique de croissance en milieu liquide de 50 souches sélectionnées dans le cadre du projet ClimHans.

Caractérisation de la tolérance au cuivre de ces 50 souches en milieu liquide.

Microbiologie pasteurienne, physiologie microbienne, analyses de résultats, mise en forme, traitement de données et valorisation

Le/La candidat(e) devra présenter des compétences en microbiologie et plus particulièrement des levures, mais également en statistique et bioinformatique. La rigueur et l’autonomie seront également attendu. Une connaissance de la filière viti-vinicole serait un plus