Traitement de données en spectrométrie de masse haute résolution (MetID / Métabolomique)

Le stage se déroulera au Laboratoire GEC – Université de Technologie de Compiègne (UTC), dans un environnement pluridisciplinaire combinant chimie analytique, biologie cellulaire et data science. Le laboratoire est équipé de plusieurs instruments des spectrométries de masse (GC-Orbitrap, LC-QTOF, LC-TripleQuad) et d’un environnement de calcul pour le traitement de données exposomiques. Les approches expérimentales seront effectuées majoritairement par d’autres stagiaires.

Dans le cadre des travaux menés au sein de l’équipe « Science des aliments » du laboratoire GEC (UTC), ce stage s’inscrit dans les recherches visant à caractériser les transformations de contaminants environnementaux (PFAs, Chloridazon) à l’aide de la spectrométrie de masse haute résolution (GC-Orbitrap, LC-QTOF).

L’objectif est de développer et automatiser des approches de Metabolite Identification (MetID) et de profilage non ciblé à partir de jeux de données complexes issus d’expériences in vitro et environnementales.

Master 2 en chimie analytique, chimie des substances naturelles, ou bio-informatique appliquée à la spectrométrie de masse ;

· connaissances solides en spectrométrie de masse (HRMS) et chromatographie liquide (LC) ;

· appétence pour le traitement de données, Python / R, et les outils de data visualization ;

· rigueur scientifique, autonomie et goût pour le travail en équipe.