Développement d’anticorps monoclonaux pour le diagnostic et le traitement des infections à Klebsiella pneumoniae hypervirulentes // Development of monoclonal antibodies for the diagnostic and the treatement of hypervirulent-Klebsiella pneumoniae

Nous observons depuis quelques années l’émergence de souches de Klebsiella pneumoniae hyper-virulentes (hvKp) devenues très résistantes aux antibioques. Dans un contexte de raréfaction des options antibiotiques, les anticorps (Ac) monoclonaux dirigés contre des antigènes capsulaires bien conservés de ses souches d’HvKp apparaissent comme une alternative thérapeutique prometteuse.
Ce projet de thèse s’articule autour de trois objectifs complémentaires :
1. Décrire la circulation des clones de hvKp par analyse génomique comparative des souches collectées via le Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques et via une collaboration internationale.
2. Produire et caractériser des Ac monoclonaux dirigés contre la capsule de HvKp.
3. Développer un outil de détection rapide basé sur l’analyse des profils MALDI-TOF couplée à des algorithmes de machine learning.
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For several years, we have observed the emergence of hypervirulent (hvKp) strains of Klebsiella pneumoniae that have become highly resistant to antibiotics. In a context of dwindling antibiotic options, monoclonal antibodies (Abs) directed against well-conserved capsular antigens of these hvKp strains appear as a promising therapeutic alternative.
This PhD project is structured around three complementary objectives:
1. To describe the circulation of hvKp clones through comparative genomic analysis of strains collected via the French National Reference Center for Antibiotic Resistance and through an international collaboration.
2. To produce and characterize monoclonal Abs directed against the HvKp capsule.
3. To develop a rapid detection tool based on MALDI-TOF profile analysis coupled with machine learning algorithms.
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Pôle fr : Direction de la Recherche Fondamentale
Département : Institut de biologie François JACOB
Service : Immunologie des maladies virales et auto-immunes-Infectious Disease Models and Innovative Therapies
Laboratoire : Laboratoire des Pathogènes Gram-négatifs multirésistants
Date de début souhaitée : 01-10-2026
Ecole doctorale : Innovation Thérapeutique: du Fondamental à l’Appliqué (ITFA)
Directeur de thèse : DORTET Laurent
Organisme : AP-HP
URL : https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/IDMIT.aspx

Public/private mixed funding

Pôle fr : Direction de la Recherche Fondamentale
Département : Institut de biologie François JACOB
Service : Immunologie des maladies virales et auto-immunes-Infectious Disease Models and Innovative Therapies

Master 2 Microbiologie et Immunologie