Isolation et caractérisation des protéines interfaciales des oléosomes de microalgue

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Notre laboratoire s’appuie sur une expertise de pointe en matière de spectrométrie de masse, couplée à diverses techniques de séparation et d’enrichissement. Parmi les outils clés figurent la détection MALDI-TOF/TOF MS, utilisée pour la cartographie moléculaire, l’imagerie tissulaire et le screening archéologique. La nanochromatographie liquide (nanoLC) couplée à la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) offre une sensibilité et une précision accrues pour l’analyse de mélanges complexes et l’identification de modifications post-traductionnelles.

Les microalgues constituent une source potentielle durable de protéines et lipides alimentaires, alignée sur les Objectifs de développement durable (ODD). Comme chez tous les règnes du vivant, elles contiennent des structures de réserve lipidique appelées oléosomes. Celles-ci sont constituées d’un corps de lipides neutres entouré d’une monocouche de lipides polaires associée à des protéines spécifiques. Impliquées dans divers processus biologiques, les oléosomes des plantes terrestres suscitent un intérêt croissant pour leurs applications industrielles. Cependant, les oléosomes des microalgues, et leurs compositions restent peu étudiés. 
L’objectif de ce stage est, dans un premier temps, de mettre en place une méthode d’isolement des protéines interfaciales des oléosomes de microalgues. L’extrait brut d’oléosomes sera fourni dans le cadre d’une thèse menée en parallèle. L’objectif principal du stage sera ensuite d’analyser et d’identifier ces protéines par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution.
Programme scientifique et technique :
1.    Purification des oléosomes à partir de l’extrait brut.
2.    Isolation des protéines interfaciales.
3.    Caractérisation les protéines extraites utilisant nanoLC-MS
 

Le candidat devra pouvoir:

Faire preuve d'initiative et d'autonomie

Respecter la rigueur scientifique

Prendre en main les méthodes de purification et d'analyse des protéines utilisées au laboratoire notamment en gel électrophorèse et en spectrométrie de masse

Faire des points réguliers sur l'avancée du projet, présentations orales en Français ou Anglais

Rédiger des rapports d'activités en Français ou Anglais