Rôle de l'épitranscriptomique de l'ARN ribosomique dans la plasticité et l'hétérogénéité des Glioblastomes // Ribosomal RNA epitranscriptomic in glioblastoma heterogeneity and plasticity

Le profilage de la 2'-O-méthylation (Nm) de l'ARN ribosomique (ARNr) permet d'identifier les glioblastomes (GB) IDHwt parmi les gliomes diffus de haut grade de l'adulte (Paraqindes et al., Neuro-Oncol 2023), mais varie également entre les différents sous‑types cellulaires de GB, qui présentent un degré élevé de plasticité responsable de la résistance aux traitements et des rechutes de la maladie. Le projet vise à déterminer la contribution fonctionnelle des modifications chimiques de l'ARNr, notamment la Nm, dans les GB IDHwt. Les objectifs sont les suivant:
1. Identifier une signature de marques épitranscriptomiques de l'ARNr (Nm) chez des patients présentant une signature moléculaire particulière.​
2.Établir des organoïdes dérivés de patients atteints de GB (PDO) et des lignées cellulaires dérivées de ces patients
3. Identifier les altérations des marques épitranscriptomiques de l'ARNr et de l'expression des snoARN qui régulent la Nm entre les différents sous‑types cellulaires de GB, en fonction de leurs capacités de plasticité.​
4. Décrypter l'impact des marques épitranscriptomiques de l'ARNr et des snoARN sur les programmes de traduction qui sous‑tendent les propriétés spécifiques des sous‑types cellulaires et la plasticité cellulaire responsable de la résistance aux traitements et des récidives.
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rRNA 2'Omethylation (Nm) profiling identifies IDHwt GB among high grade diffuse adult gliomas (Paraqindes et al, Neuro-Oncol 2023), but also varies among GB cellular subtypes, which display high degree of plasticity responsible for treatment resistance and disease relapse. We will determine the functional contribution of rRNA chemical modifications in IDH wild-type GBs. The objectives are:
1. Identify a signature of rRNA epitranscriptomics marks (Nm) in patients with particular molecular signature;
2. Establish GB patient-derived organoids (PDOs) and cell lines derived from patients;
3. Identify alterations in rRNA epitranscriptomic marks and snoRNA expression between the different GB cellular subtypes, depending on plasticity capacities;
4. Decipher the impact of snoRNA/rRNA epitranscriptomics marks on translational programs underlying cell subtypes specific properties and cellular plasticity responsible for treatment resistance and disease recurrence.
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Début de la thèse : 26/10/2026
WEB : https://eureca.scienseed.com

Programmes de l'Union Européenne de financement de la recherche (ERC, ERASMUS)

Université Claude Bernard Lyon 1

656 CanBioS - Cancérologie, Biologie, Santé de Lyon

Exigences Domaine de recherche : L1 – Biologie moléculaire et structurale, L2 – Génétique, génomique, bioinformatique et biologie des systèmes. Niveau d'études : Master européen ou équivalent. Compétences / Qualifications - Master en sciences de la vie, biologie moléculaire, cancérologie ou domaines apparentés. - Expérience dans au moins un des domaines suivants : biologie cellulaire et/ou moléculaire, biochimie, biologie de l'ARN. - Intérêt démontré pour la recherche sur le cancer et la biologie de l'ARN. - Excellents résultats académiques appréciés. - Une expérience pratique en laboratoire constitue un atout. - Connaissances de base de Microsoft Office, en statistiques et en présentation graphique des données. - Excellentes capacités d'organisation et de communication, et goût pour le travail collaboratif. - Volonté de voyager pour des périodes courtes ou plus longues. - Flexibilité, sens de la coopération, et manière de travailler structurée et autonome. - Maîtrise de l'anglais écrit et oral indispensable Critères d'éligibilité - Vous devez être titulaire d'un diplôme de Master of Science (MSc) ou équivalent à la date de recrutement.​ - Vous ne devez pas être en possession d'un doctorat à la date du recrutement. Les chercheurs ayant soutenu avec succès leur thèse de doctorat mais n'ayant pas encore reçu formellement le titre de docteur ne seront pas considérés comme éligibles.​ Règle de mobilité Les candidats peuvent être de n'importe quelle nationalité. Les candidats ne doivent pas avoir résidé ou exercé leur activité principale (travail, études, etc.) en France pendant plus de 12 mois au cours des 36 mois précédant immédiatement leur date de recrutement.​ Le service national obligatoire, les séjours de courte durée tels que les vacances et le temps passé par le chercheur dans le cadre d'une procédure d'obtention du statut de réfugié au titre de la Convention de Genève ne sont pas pris en compte.​ Avantages - Le contrat de travail suivra les conditions et le salaire adaptés au coût de la vie dans chaque pays d'accueil, fixés par le Programme de travail Horizon Europe 2023-2025, MSCA.​ - Le salaire mensuel brut comprendra une allocation de subsistance brute (4 735,81 €/mois) corrigée d'un facteur lié au pays d'emploi et diminuée de toutes les déductions obligatoires prévues par la législation nationale telles que les cotisations de sécurité sociale de l'employeur et de l'employé et les impôts directs, une allocation de mobilité (710 €/mois) et, le cas échéant, une allocation familiale (660 €/mois).​ Processus de sélection Processus de sélection en 3 étapes comprenant :​ - Une présélection basée sur l'éligibilité et le dossier de candidature écrit.​ - Un premier entretien avec un petit jury de l'institution d'accueil.​ - Un second entretien avec un jury élargi.​ Comment postuler Envoyez un CV, une lettre de motivation et les coordonnées de 2 références en utilisant la plateforme adum – numéro de référence 68360 (https://adum.fr/index.pl). Un générateur de CV utile qui facilite la création de votre CV en ligne se trouve ici : EUROPASS CV.
Requirements - Research field: L1-Molecular and Structural Biology, L2-Genetics, Genomics, Bioinformatics and Systems Biology - Education level: European Master Degree or equivalent Skills/Qualifications - Master Degree in life sciences, molecular biology, cancers, or related fields. - Experience in at least one of the following areas: cell and/or molecular biology, biochemistry, RNA biology. - Demonstrated interest in cancer research and RNA biology - Demonstrated academic excellence is a pre. - Practical experience in laboratory environment is a plus. - Basic knowledge of Microsoft office, statistics, graphical data presentation. - Excellent organisation and communication skills and a collaborative mindset. - Willing to travel for short or longer periods. - Flexible and co-operative with a well-structured and autonomous working style. - Fluency in written and spoken English is a must. Additional Information Eligibility criteria - You must hold Master of Science degree (MSc) or equivalent at the date of recruitment. - You cannot be in possession of a doctoral degree at the date of the recruitment. Researchers who have successfully defended their doctoral thesis but who have not yet formally been awarded the doctoral degree will not be considered eligible. Mobility rule Candidates can be of any nationality. Candidates must not have resided or carried out their main activity (work, studies, etc.) in France for more than 12 months in the 36 months immediately before their recruitment date. Compulsory national service, short stays such as holidays and time spent by the researcher as part of a procedure for obtaining refugee status under the Geneva Convention are not taken into account. Benefits: The employment contract will follow the conditions and salary adapted to the life cost in each host country, set by the Horizon Europe Work Programme 2023-2025, MSCA. The monthly gross salary will comprise a gross living allowance (€4735,81/month) corrected by a country-of-employment factor and minus all compulsory deductions under national legislation such as employer and employee social security contributions and direct taxes, mobility allowance (€710/month) and if applicable a family allowance (€660/month). Selection process: 3 steps selection process including: A preselection based on eligibility and written application First interview with a small panel from host institution Second interview with a larger panel How to apply: Send a CV, motivation letter and the contact information of 2 references to using adum platform – reference number 68360 (https://adum.fr/index.pl). A useful CV builder that makes it easy to create your CV online can be found here: EUROPASS CV EUROPASS