Approches nutritionnelles et multi-omiques pour comprendre et réduire les myopathies des muscles pectoraux chez le poulet de chair

Contexte

Les myopathies des muscles pectoraux, notamment les striations blanches (white striping), le durcissement de la poitrine (wooden breast) et la déstructuration de la poitrine (spaghetti meat), constituent un enjeu majeur pour l'industrie du poulet de chair. Ces myopathies, d'origine non infectieuse, sont associées à la croissance rapide des poulets modernes et à des déséquilibres métaboliques impliquant l'hypoxie musculaire, le stress oxydatif et une régénération musculaire déficiente. Elles entraînent une dégradation de la qualité de la viande, une diminution du rendement à la transformation et des pertes économiques importantes pour la filière avicole.

Les stratégies actuelles visant à réduire la prévalence de ces myopathies reposent principalement sur des restrictions alimentaires ou une réduction de la vitesse de croissance, ce qui entraîne souvent une diminution du rendement en viande et une baisse de la rentabilité. Ces approches ne ciblent pas directement les mécanismes biologiques responsables du développement des myopathies. Une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans la croissance musculaire, la régénération musculaire et la réponse au stress oxydatif et hypoxique est donc nécessaire afin de développer des stratégies nutritionnelles innovantes permettant de réduire les myopathies tout en maintenant les performances zootechniques.

Ce projet de doctorat propose d'étudier l'effet de différentes stratégies nutritionnelles, notamment la supplémentation en carnosine, L-carnitine et HMB, administrées par injection in ovo et/ou par supplémentation alimentaire post-éclosion, sur la croissance musculaire, la régénération musculaire, la qualité de la viande et la prévalence des myopathies des muscles pectoraux chez le poulet de chair. Le projet combinera des approches de physiologie musculaire, d'histologie, de biologie moléculaire et d'analyses multi-omiques (transcriptomique, protéomique, phosphoprotéomique) afin de mieux comprendre les mécanismes biologiques reliant nutrition, croissance musculaire et développement des myopathies.

Objectifs du projet

1. Étudier l'effet de stratégies nutritionnelles incluant la carnosine, la L-carnitine et le HMB administrés in-ovo et/ou post-éclosion sur les performances zootechniques, le rendement en viande et la qualité de la viande chez le poulet de chair.
2. Évaluer l'effet de ces stratégies nutritionnelles sur la prévalence et la sévérité des myopathies des muscles pectoraux et sur les caractéristiques histologiques du muscle.
3. Étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans la croissance musculaire, la régénération musculaire, le stress oxydatif et l'hypoxie musculaire par des approches combinant transcriptomique, protéomique et phosphoprotéomique.
4. Intégrer les données phénotypiques, histologiques et multi-omiques afin d'identifier les voies moléculaires et les mécanismes biologiques associés au développement des myopathies et à la réponse aux interventions nutritionnelles.
5. Intégrer les connaissances générées par ce projet afin d'élaborer des recommandations et des stratégies nutritionnelles applicables en production avicole commerciale visant à réduire la prévalence des myopathies des muscles pectoraux, à améliorer la qualité de la viande et à diminuer les pertes économiques associées.

Environnement de travail

La personne recrutée travaillera au sein d'une équipe de recherche du Département des sciences animales de la Faculté des sciences de l'Agriculture et de l'Alimentation de l'Université Laval. Le projet sera réalisé en collaboration avec des partenaires industriels et des plateformes de génomique et de protéomique, offrant un environnement de recherche multidisciplinaire combinant production avicole, physiologie musculaire, biologie moléculaire et bio-informatique.

Missions

La personne recrutée pilotera ce projet de doctorat. Elle participera à la conception et à la mise en place des essais expérimentaux, au suivi de l'élevage des oiseaux, à l'organisation et à la réalisation des prélèvements, aux analyses de laboratoire (histologie, biologie moléculaire, analyses omiques), ainsi qu'aux analyses statistiques et bio-informatiques des données. Elle participera également à la diffusion des résultats de la recherche sous forme de communications orales et écrites dans des congrès scientifiques nationaux et internationaux, ainsi qu'à la rédaction d'articles scientifiques.

Le Département des sciences animales a comme mission d’assurer le leadership québécois dans le domaine des sciences animales. Par la formation de professionnels hautement compétents, il assure la transmission de nouveau savoir et maintient un lien étroit avec les divers intervenants de l’agroalimentaire. Il se donne comme objectif d’être partenaire sur une base internationale au développement afin de répondre aux besoins spécifiques des productions animales.

Ses activités d'enseignement et de recherche s’appliquent notamment aux disciplines suivantes :

• Alimentation, nutrition et physiologie animale
• Physiologie et biotechnologie de la reproduction
• Production et qualité de la viande
• Gestion technico-économique des troupeaux

• Diplôme de maîtrise en sciences animales, biologie, biotechnologie, biochimie, physiologie ou domaine connexe.
• Connaissances de base en biologie moléculaire (ex. PCR, qPCR, Western blot, extraction d'ADN/ARN).
• Intérêt pour la physiologie musculaire, la nutrition animale ou la production avicole.
• Intérêt pour l'analyse de données biologiques et les approches omiques (transcriptomique, protéomique).
• Expérience ou intérêt pour l'analyse statistique (R) sera considérée comme un atout.
• Habilités à travailler avec les animaux d'élevage et à participer aux essais expérimentaux.
• Capacité à lire et rédiger des articles scientifiques en anglais.
• Autonomie, sens de l'organisation, rigueur scientifique et capacité à travailler en équipe.
• Bon dossier académique.