Développement d'un modèle in vitro imitant l'environnement pulmonaire pour étudier les interactions bactériennes afin de mieux prédire la pneumopathie acquise sous ventilation mécanique // Development of an in vitro model mimicking lung environment for st

La pneumonie acquise sous ventilation mécanique (PAVM) demeure l'infection nosocomiale la plus fréquente et la première cause de prescription d'antibiotiques en réanimation. La colonisation des voies respiratoires est un facteur de risque reconnu, mais elle n'est pas systématiquement associée à la survenue d'une PAVM. Staphylococcus aureus est un pathogène majeur, responsable de près d'un quart des cas de PAVM en Europe occidentale. Cependant, de nombreux patients colonisés par S. aureus ne développent jamais de PAVM, ce qui suggère un rôle protecteur potentiel du microbiote respiratoire.
L'objectif principal de cette thèse est de démontrer l'effet protecteur ou délétère de certains taxons du microbiote respiratoire sur le développement précoce de la PAVM à S. aureus et de développer un outil de PCR quantitative ciblant ces bactéries afin de mieux identifier les patients à haut et à faible risque de développer une PAVM.
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Ventilator-associated pneumonia (VAP) remains the most common healthcare-associated infection and the first cause of antibiotic prescription in intensive care units (ICU). Colonization of the respiratory tract is a recognized risk factor, but it is not systematically associated with the onset of VAP. Staphylococcus aureus is a major pathogen, accounting for nearly a quarter of VAP cases in Western Europe. However, many patients colonized with S. aureus never develop VAP, suggesting a potential protective role of the respiratory microbiota.
The overall objective of the thesis is to show a protective or deleterious effect of some taxa of the respiratory tract microbiota on the development of early S. aureus VAP and to develop a quantitative PCR-based tool targeting those bacteria to better identify patients at high and low risk of VAP development.
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Début de la thèse : 01/10/2026

Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)

Concours pour un contrat doctoral

Université de Limoges

652 Biologie, Chimie, Santé

Expertise en bactériologie fondamentale: culture bactérienne (courbe de croissance, coculture…), biologie moléculaire (PCR, qPCR, ddPCR, NGS…) Bon niveau d'anglais
Expertise in fundamental bacteriology: bacterial culture (growth curve, coculture…), molecular biology (PCR, qPCR, ddPCR, NGS…) Good level of English