Approches topologiques et spectrales pour l'étude de l'évolution des structures protéiques chez les virus eucaryotes et de leur impact sur l'évolution des eucaryotes (31/05/2026) // Topological and spectral approaches to protein structure evolution in euk

Ce projet vise à développer une approche géométrique et topologique de l'évolution des structures protéiques en combinant analyse topologique des données, géométrie spectrale et modélisation. L'objectif est de caractériser les similitudes structurelles et les relations évolutives entre les protéines à l'aide de descripteurs qui rendent compte à la fois de la géométrie globale et de l'organisation topologique locale. Au-delà de la biologie évolutive, ce projet pourrait contribuer à l'élaboration de nouvelles représentations mathématiques des structures protéiques.
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This project proposes a geometric and topological approach to protein structure evolution by combining topological data analysis, spectral geometry, and modelling. The objective is to characterize structural similarities and evolutionary relationships between proteins using descriptors that capture both global geometry and local topological organisation. Beyond evolutionary biology, the project will contribute to the development of new mathematical representations of protein structures.
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Début de la thèse : 01/10/2026

Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)

Concours pour un contrat doctoral

Université Claude Bernard Lyon 1

341 E2M2 - Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation

Nous recherchons un candidat ayant une formation en bio-informatique, en biologie structurale ou en biologie computationnelle, avec un vif intérêt pour les mathématiques, l'informatique et l'analyse de données.
We are looking for a candidate with a background in bioinformatics, structural biology, or computational biology, with a strong interest in mathematics, computer science and data analysis.