Doctorat en microfabrication pour l'imagerie biologique et la culture d'assemblages cellulaires biologiques (H/F) // Ph.D. in Microfabrication for Biological Imaging and the Cultivation of Biological Cell Assemblies (M/F)

Sujet de thèse
Le projet PAPILLON développe une plateforme intégrée pour piloter et quantifier la différenciation de
sphéroïdes humains dérivés de cellules souches pluripotentes induites. Trois verrous structurent le projet : architecture et fabrication de la puce PAPILLON, programmation fluidique de la différenciation, et intégration dans un système d'imagerie et d'analyse automatisées.
Il repose d'abord sur le développement d'une puce microfluidique permettant le piégeage contrôlé d'une dizaine de sphéroïdes et compatible avec une imagerie avancée en conditions d'incubation. Dans cette puce, des séquences automatisées et finement modulées de perfusion de milieux de culture imposeront des trajectoires de différenciation reproductibles aux sphéroïdes.
On fera l'imagerie en temps réel de cette dynamique pour produire des données moyen débit sur cette physiologie des sphéroïdes. L'accent sera mis sur une approche à bas coût et largement open source afin d'abaisser les barrières technologiques pour la communauté.
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The PAPILLON project is developing an integrated platform to control and quantify the differentiation of human spheroids derived from induced pluripotent stem cells. The project is structured around three key components: the design and fabrication of the PAPILLON chip, fluidic programming of differentiation, and integration into an automated imaging and analysis system. It is based primarily on the development of a microfluidic chip capable of trapping about ten spheroids under controlled conditions and compatible with advanced imaging during incubation. Within this chip, automated and finely modulated sequences of culture medium perfusion will impose reproducible differentiation trajectories on the spheroids. We will perform real-time imaging of these dynamics to generate mid-throughput data on the physiology of the spheroids. The focus will be on a low-cost and largely open-source approach to lower technological barriers for the community
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Début de la thèse : 01/10/2026

Other public funding

CNRS

Université de Bordeaux

209 Sciences Physiques et de l'Ingénieur

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