Consortia bactériens pour le biocontrôle en agriculture

Construire et comprendre des assemblages de bactéries de biocontrôle pour mieux protéger les cultures agricoles et réduire l’usage de pesticides de synthèse dans les champs, à l’aide de techniques de microbiologie, de biologie moléculaire et de bio-informatique avancées.

• Bourse annuelle garantie : 27 000 $
• Programme : doctorat
• Durée minimale : 3 ans
• Début : Janvier 2027

LE PROJET

Ce projet vise à explorer des consortia de bactéries de biocontrôle comme alternatives aux pesticides de synthèse, afin d’améliorer l’empreinte environnementale de l’agriculture. Il se trouve au croisement de la microbiologie, de la biologie végétale et de l’écologie. Vous plongerez au cœur des interactions entre des bactéries de biocontrôle qui, rassemblées en consortia, peuvent mener à une meilleure protection des plantes. Le projet s’appuiera sur le modèle de la pourriture blanche du soya, causée par le champignon pathogène Sclerotinia sclerotiorum, qui entraîne chaque année dans le monde des pertes de récolte majeures. Vous explorerez en particulier le potentiel de bactéries endophytes à protéger le soya.

CE QUE VOUS FEREZ

• Caractérisation de bactéries endophytes
• Séquençage du microbiome
• Analyse de génomes bactériens
• Étude de consortia bactériens
• Essais en plantes en conditions contrôlées
• Mutagénèse dirigée

COMPÉTENCES VISÉES

• Culture microbienne
• Culture de plantes
• Manipulation de pathogènes
• Biologie moléculaire
• Séquençage du microbiome
• Analyses bio-informatiques
• Visualisation de données 

La personne recrutée rejoindra l'équipe de Dr. Antoine Zboralski à l’Institut de recherche en biologie végétal (IRBV). L'institut est situé au cœur du Jardin botanique et de la ville de Montréal. Il compte ~100 étudiant.e.s et 20 équipes de recherche multidisciplinaires. De nombreuses activités scientifiques et sociales sont organisées toute l'année, contribuant à entretenir une communauté dynamique et accueillante.

• Master en microbiologie, biologie végétale, phytopathologie ou domaine connexe
• Fort intérêt pour le travail de laboratoire
• Expérience en culture microbienne
• Connaissances en analyses bio-informatiques
• Autonomie, rigueur et curiosité scientifique