Rythmicité circadienne de l’horloge et de l’UPR dans l’épithélium intestinal sain ou inflammatoire

Le stage aura lieu sur le campus Villejean de l'Université de Rennes, dans un des batiments de l'Unité Inserm 1242 "Oncogenesis & Stress Signaling".

L'unité, adossée à l'Université de Rennes et au Centre Eugène Marquis, est composée de 4 équipes de recherche. Le projet sera effectué dans l'équipe Platon dirigée par Cédric Coulouarn (DR Inserm), sous la supervision de Yohan Bignon (CR Inserm).

Type de Poste: 

Stage de M2 (avec convention d'accueil) parcours Biologie/Santé, à partir de Janvier 2027, dont l'objectif est de participer à un projet de recherche au sein de l'Unité Inserm 1242 de Rennes.

Description du projet de recherche:

L’origine des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) n’est pas connue, mais pourrait être associée à une perte de résilience de l’épithélium intestinal face aux variations de son environnement. L’UPR (Unfolded Protein Response), réponse adaptative des cellules qui assure l’homéostasie protéique en condition de stress, pourrait jouer un rôle central dans cette vulnérabilité. Elle est dérégulée chez les patients atteints de MICI, y compris dans les régions non-inflammatoires de leur épithélium intestinal. L’origine de cette dérégulation n’est cependant pas connue. Or, de récentes données suggèrent que l’UPR puisse être activée de façon périodique au cours du cycle jour/nuit. Cette rythmicité pourrait être orchestrée par l’Horloge circadienne, un mécanisme cellulaire qui fait osciller la transcription des gènes au cours du cycle circadien et qui est lui-même dérégulé durant l’inflammation intestinale.

Le but du stage est de déterminer, par une combinaison d’approches in vitro et in vivo, si l’UPR est activée de façon rythmique dans les cellules épithéliales du côlon et si sa rythmicité est dérégulée durant la colite.

Deux objectifs principaux :

1) Analyser la rythmicité circadienne de marqueurs de l’horloge (ex. BMAL1, REV-ERBα) et de l’UPR (XBP1s, ATF6, CHOP, AGR2…) in vitro, dans la lignée cellulaire Caco-2 et des organoïdes intestinaux dérivés d’épithélium colique sain synchronisés, par Western blot (WB), RT-qPCR et immunofluorescence (IF) à différents temps circadiens.

2) Caractériser la rythmicité des mêmes marqueurs in vivo, dans le côlon de souris C57Bl/6j sauvages, en condition normale ou durant une colite expérimentale, par WB, RT-qPCR et immunohistochimie (IHC) à différents temps circadiens.

Le stage comprendra une phase d’apprentissage des techniques non-maitrisées et une phase d’autonomisation sous encadrement. Il offre une initiation pratique à la chronobiologie expérimentale et à la physiopathologie intestinale.

Le candidat recherché est un étudiant de M2 ayant validé sa 1ère année de M1 avec de bons résultats.

En l'absence de financement, le stage ne pourra mener à la poursuite en doctorat au sein de l'équipe.