Doctorat (PhD) en génétique et génomique fonctionnelle des maladies cardiovasculaires

Les intérêts de recherche du laboratoire s’articulent autour de la compréhension des mécanismes génétiques et moléculaires impliqués dans le développement et la progression des maladies cardiovasculaires, notamment la sténose aortique et la maladie coronarienne. Longtemps perçue comme une succession d’évènements passifs liés au vieillissement, ces pathologies découlent d’un processus cellulaire complexe menant à l’altération de mécanismes moléculaires et/ou épigénétiques dérégulant ainsi le programme transcriptionnel. Dans ce contexte, plusieurs stratégies expérimentales et analytiques font l’objet d’une attention particulière au sein du laboratoire.  

Identification d’acteurs moléculaires impliqués dans la physiopathologie des maladies cardiovasculaires. Nos recherches visent à comprendre comment les éléments régulateurs non codants et les variants génétiques contrôlent l’expression génique et régissent les programmes génétiques à l’origine des valvulopathies cardiaques. Pour caractériser ces mécanismes de régulation, nous intégrons plusieurs approches génomiques, notamment l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP-seq), le profilage de l’accessibilité de la chromatine (ATAC-seq) et la cartographie des interactions chromatiniques en 3D (HiChIP, HIC). Récemment, nous avons mis au point des criblages de perturbation par interférence CRISPR (CRISPRi) à haut débit sur des cellules individuelles de cellules interstitielles de la valve aortique humaine afin d’établir un lien entre les éléments régulateurs non codants et les variants associés à la maladie, d’une part, et leurs gènes cibles ainsi que les programmes cellulaires en aval, d’autre part.

Le laboratoire du Dr Patrick Mathieu est à la recherche d’étudiants dynamiques et motivés pour se joindre à son équipe afin de réaliser une thèse de doctorat axé sur la compréhension des mécanismes génétiques et moléculaires impliqués dans le développement des maladies cardiovasculaires. Le laboratoire du Dr Mathieu est affilié à l’Université Laval et est situé à l’Institut de Cardiologie et de Pneumologie de Québec (IUCPQ), centre qui regroupe des axes de recherche en cardiologie, en pneumologie et en obésité/métabolisme, trois sphères à fort impact économique et sociétal considérant les maladies qui y sont liées. De par son expertise en traitement des maladies cardiovasculaires, l'IUCPQ procure à notre équipe de recherche une ressource unique et précieuse de cellules primaires, mises en culture à partir de tissus cardiaques provenant de patients opérés.

Qualifications:

Avoir obtenu un diplôme de master dans l’un des domaines suivants ou équivalent : Sciences biomédicales, Biologie, Biochimie, Microbiologie, Bio-informatique.

Le ou la candidate recherché(e) devra posséder :

• De fortes connaissances théoriques en biologie cellulaire et moléculaire;
• De solides compétences en travail de laboratoire (EX: qRT-PCR, western blot, culture cellulaire, ChIP, etc.)
• Un esprit analytique et qui aime résoudre des problèmes complexes;
• Une bonne autonomie;
• De très bonnes aptitudes en rédaction et présentation : anglais et français.

Seront favorisés les candidats possédant également : 

• Des compétences ou fort intérêt pour la bio-informatique et l’analyse des données génomique (e.g. ChIP-seq, ATAC-seq, GWAS, RNA-seq, génome 3D)
• Des compétences en programmation (Bash, R, Python)

Qualités recherchées :

• Personne hautement dynamique, rigoureuse, responsable et engagée;
• Bonne autonomie et polyvalence;
• Bonnes aptitudes à travailler en équipe.

Pour plus de renseignements :

• Centre de recherche de l’Institut de Cardiologie et de Pneumologie de Québec-Université Laval: https://iucpq.qc.ca/fr/recherche
• Programme de PhD en Médecine Moléculaire de l’Université Laval: https://www.ulaval.ca/etudes/programmes/doctorat-en-medecine-moleculaire#presentation-generale&recherche-domaine
• Site web du laboratoire Patrick Mathieu : https://www.patrickmathieulab.ca/