Comment les enzymes diffusent dans les matrices polymères qu’elles dégradent ?

Une thèse de 36 mois est proposée à Toulouse Biotechnology Institute (TBI), dans le cadre du projet ANR CATCHY. À l’interface entre enzymologie, biophysique et physique de la matière molle, elle vise à comprendre comment l’activité catalytique et les propriétés moléculaires des enzymes contrôlent leur progression dans une matrice polymère.

L’arabinoxylane sera utilisé comme polymère modèle, sous forme de solutions semi-diluées ou de gels. Le travail comportera deux volets principaux : la production, l’ingénierie et le marquage fluorescent d’enzymes dégradant le polymère ; puis la mesure de leur migration dans les matrices polymères par microscopie de fluorescence afin de déterminer des diffusivités effectives. Les résultats expérimentaux seront confrontés aux travaux réalisés en parallèle par les laboratoires partenaires du projet : simulations de dynamique moléculaire réalisées à IATE (Montpellier), mesures de mobilité des chaines de polymère lors de la dégradation par 'photon correlation imaging' au L2C (Montpellier).

Un descriptif détaillé est accessible au lien suivant : https://sdrive.cnrs.fr/s/EzsXdZabARSCapN

TBI mêle recherche fondamentale et appliquée dans le domaine des biotechnologies. Croisant excellence scientifique avec pertinence économique et sociétale, le laboratoire est structuré en 4 pôles scientifiques et 1 pôle technologique. L’unité, avec des compétences disciplinaires fortes en Sciences du Vivant et Sciences de l’Ingénieur, conduit une stratégie scientifique multi-échelles, multidisciplinaire et interdisciplinaire, afin de relever les enjeux de la bioéconomie, et associant un important réseau de collaborateurs publics et privés. Fort d’une expertise de plus de 40 ans et internationalement reconnu, TBI réalise des activités de recherche en catalyse et ingénierie enzymatique, biologie systémique et synthétique, fermentation, génie des procédés et éco-conception. L'unité est également l'un des laboratoires labellisés de l'Institut Carnot 3BCar.

Nous recherchons une personne titulaire d’un master en biochimie, biocatalyse, ou biophysique, et disposant de solides bases en enzymologie et ingénierie enzymatique. Une expérience en imagerie de fluorescence ou en analyse d’images serait appréciée, de même que des connaissances de base sur les processus de diffusion, en matière molle ou physique des polymères.