Étude de la persistance virale du SARS-CoV-2 chez l'hôte : approche par imagerie in vivo pour la caractérisation du Covid long et l'exploration de perspectives thérapeutiques // Deciphering SARS-CoV-2 viral persistence with the host by in vivo imaging for

Comprendre comment les agents pathogènes interagissent avec leurs hôtes est essentiel pour lutter contre les maladies infectieuses. Ces interactions — ainsi que la manière dont le système immunitaire y répond — déterminent si une infection est résolue, devient chronique ou plus sévère encore. Dans certaines infections, la présence persistante de molécules dérivées de l'agent pathogène peut entraîner une activation immunitaire continue, provoquant une inflammation chronique et des lésions des tissus. Cette hypothèse est l'une des principales pistes envisagées pour expliquer l'origine du Covid long.
Ce projet vise à ouvrir de nouvelles perspectives en déchiffrant les mécanismes à long terme des interactions virus–hôte après une infection par le SARS-CoV-2. En identifiant la nature, la cinétique et la biodistribution des composés viraux persistants, ce projet cherche mettre en évidence des éléments essentiels pour le diagnostic et le traitement du syndrome post-Covid.
Grâce à des stratégies d'imagerie in vivo de pointe, ce projet étudiera systématiquement la persistance du SARS-CoV-2 pendant 1 an et demi dans un modèle préclinique d'infection. Des primates non-humains infectés seront suivis dans le temps par imagerie TEP (tomographie par émission de positons) du corps entier, fournissant des données en temps réel sur la persistance virale. Ces évaluations in vivo seront complétées par une analyse virologique approfondie des tissus, du sang et des muqueuses, ainsi qu'un suivi fonctionnel de la respiration et de l'activité physique.
Ensemble, ces données multiparamétriques permettront de générer une cartographie 4D de la persistance virale post-Covid, offrant une vue sur la manière dont les interactions chroniques entre le virus et l'hôte peuvent contribuer au développement du Covid long.
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Understanding how pathogens interact with their hosts is key to combating infectious diseases. These interactions—and how the immune system responds—determine whether an infection is resolved, becomes chronic, or turns fatal. In some infections, the continued presence of pathogen-derived molecules can drive persistent immune activation, leading to chronic inflammation and organ damage. This is a leading hypothesis behind the origins of Long Covid. This project aims to break new ground by deciphering the long-term mechanisms of virus–host interactions following Covid-19. By identifying the nature, kinetics, biodistribution of persistent viral compounds, this project seeks to uncover critical insights for the diagnosis and treatment of post-Covid syndrome. Using cutting-edge in vivo imaging strategies, the project will systematically investigate SARS-CoV-2 persistence over 1.5 years in a preclinical model of SARS-CoV-2 infection. Infected non-human primates will be longitudinally monitored with whole-body PET imaging providing real-time data on viral persistence. This in vivo assessment will be integrated with deep virological profiling of tissues, blood, and mucosal compartments, as well as functional monitoring of respiration and activity. Together, these multiparametric datasets will generate a 4D map of post-Covid viral persistence, offering an unprecedented view of how chronic virus–host interactions may drive Long Covid.
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Début de la thèse : 01/10/2026

Programme pour normalien ENS Paris-Saclay

Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments

569 Innovation thérapeutique : du fondamental à l'appliqué

Profil ingénieur/normalien
Engineering school/ENS graduated student