Dynamique collective et chimiotaxie bactérienne // Collective dynamics and bacterial chemotaxis

L'objectif de cette thèse est d'utiliser la microfluidique pour modéliser la colonisation de l'environnement par des bactéries, en se concentrant particulièrement sur la manière dont des bactéries comme Caballeronia insecticola colonisent l'intestin. Bien que le rôle des signaux chimiques dans ce processus ait été largement étudié, l'influence du confinement géométrique et des mouvements collectifs sur la sélection des espèces reste encore mal comprise. Dans le cadre de cette thèse, nous proposons d'utiliser la microfluidique pour reproduire les structures géométriques présentes dans les environnements naturels, afin d'en déterminer l'impact sur la sélection des espèces.
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The goal of this thesis is to use microfluidics to model bacterial colonization of environments, with a specific focus on how bacteria such as Caballeronia insecticola colonize the gut. While the role of chemical signaling in this process has been extensively studied, the influence of geometric confinement and collective motion on species selection remains poorly understood. In this thesis, we propose to use microfluidics to replicate the geometric structures found in natural environments, enabling us to determine their impact on species selection.
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Début de la thèse : 01/10/2026

Contrats ED : Programme blanc GS-SIS

Université Paris-Saclay GS Sciences de l'ingénierie et des systèmes

579 Sciences Mécaniques et Energétiques, Matériaux et Géosciences

Le candidat ou la candidate devra posséder une solide formation en microbiologie ou en mécanique des fluides. Un vif intérêt pour la conception et la réalisation d'expériences, ainsi que pour le traitement et l'analyse d'images, sera particulièrement apprécié.
The successful candidate should have a strong background in microbiology or fluid mechanics. A keen interest in designing and conducting experiments, as well as in image processing and analysis, will be highly valued.