Post-Doctorat en électrochimie, développement d’un biocapteur pour la surveillance de pathogènes (H/F)

L’Ifremer

Le laboratoire Détection, Capteurs et Mesures (DCM) est chargé de conduire des actions de recherche nécessaires pour le développement de nouvelles technologies (capteurs chimiques, biocapteurs, capteurs optiques, ...) en relation avec les actions de l'ensemble des Département de l'Ifremer et de sociétés extérieures suivant les cas.

Le laboratoire cherche à améliorer la compréhension des phénomènes aux interfaces matériaux/milieu marin, à développer des systèmes de mesure des environnements marins et sous-marins.

Le contrat sera réalisé au sein de l'Unité Recherches et Développements Technologiques, sous la responsabilité du Responsable du Laboratoire Détection, Capteurs et Mesures.

Le poste proposé est rattaché au projet de recherche partenariale SEREMAQ, pour le développement d'un biocapteur électrochimique pour l'identification de bactéries et de virus pathogènes.

Les événements récents de contamination biologique des eaux de surface (coliformes fécaux (E. coli), norovirus), souvent consécutifs à des épisodes pluviométriques extrêmes et à des déversements d'eaux usées non maîtrisés, constituent une menace croissante pour les écosystèmes littoraux, la santé publique et l'économie conchylicole française. Les réseaux de surveillance réglementaires, notamment le réseau de contrôle microbiologique (REMI), reposent sur des méthodes de référence robustes mais impliquant des chaînes logistiques lourdes et des temps de réponse incompatibles avec une gestion opérationnelle en temps réel des risques microbiologiques.

Dans ce contexte, le projet SEREMAQ vise à développer une chaîne de mesure innovante, rapide (< 1 h), peu coûteuse et à faible empreinte carbone, permettant une quantification directe multi-cible de contaminants bactériens et viraux directement sur le terrain.

Ce projet associe des acteurs académiques et technologiques de référence : Grapheal, Ifremer (LER-LR Sète, LSEM Nantes, RDT/DCM Brest) et le CEA-LETI.

Qui sommes nous ?

Le laboratoire Détection, Capteurs et Mesures (DCM) est chargé de conduire des actions de recherche nécessaires pour le développement de nouvelles technologies (capteurs chimiques, biocapteurs, capteurs optiques, ...) en relation avec les actions de l’ensemble des Département de l’Ifremer et de sociétés extérieures suivant les cas.

Le laboratoire cherche à améliorer la compréhension des phénomènes aux interfaces matériaux/milieu marin, à développer des systèmes de mesure des environnements marins et sous-marins.

Le contrat sera réalisé au sein de l’Unité Recherches et Développements Technologiques, sous la responsabilité du Responsable du Laboratoire Détection, Capteurs et Mesures.

Le poste proposé est rattaché au projet de recherche partenariale SEREMAQ, pour le développement d’un biocapteur électrochimique pour l’identification de bactéries et de virus pathogènes.

Les événements récents de contamination biologique des eaux de surface (coliformes fécaux (E. coli), norovirus), souvent consécutifs à des épisodes pluviométriques extrêmes et à des déversements d’eaux usées non maîtrisés, constituent une menace croissante pour les écosystèmes littoraux, la santé publique et l’économie conchylicole française. Les réseaux de surveillance réglementaires, notamment le réseau de contrôle microbiologique (REMI), reposent sur des méthodes de référence robustes mais impliquant des chaînes logistiques lourdes et des temps de réponse incompatibles avec une gestion opérationnelle en temps réel des risques microbiologiques.

Dans ce contexte, le projet SEREMAQ vise à développer une chaîne de mesure innovante, rapide (< 1 h), peu coûteuse et à faible empreinte carbone, permettant une quantification directe multi-cible de contaminants bactériens et viraux directement sur le terrain.

Ce projet associe des acteurs académiques et technologiques de référence : Grapheal, Ifremer (LER-LR Sète, LSEM Nantes, RDT/DCM Brest) et le CEA-LETI.

Missions principales

-           Contribuer au développement scientifique et méthodologique de la chaîne de mesure de terrain (préconcentration, détection, validation),

-           Participer à la définition des cibles microbiologiques pertinentes (bactéries indicatrices et pathogènes),

-           Évaluer les performances analytiques du système (sensibilité, spécificité, robustesse en milieu salin),

-           Assurer la validation scientifique des résultats obtenus par comparaison avec les méthodes de référence conventionnelles

Activités principales

-           Développer en partenariat un biocapteur électrochimique à base de graphène, dédié à la reconnaissance d’E. coli et de norovirus (optimisation de la fonctionnalisation, sélection des anticorps et aptamères,…),

-           Optimisation de la chaine de mesure (du prélèvement à l’analyse par le capteur),

-           Validation du biocapteur et de la chaine de mesure avec des échantillons enrichis et environnementaux,

-           Comparer systématiquement les résultats SEREMAQ aux méthodes de référence (REMI, analyses microbiologiques classiques),

-           Participer aux campagnes de déploiement sur les sites pilotes (Méditerranée et Bretagne),

-           Valoriser les résultats sous forme de rapports, communications scientifiques et publications.

Avec qui travaillerez-vous ?

Vous serez principalement hébergé au laboratoire LDCM (Ifremer), basé sur le centre Bretagne à Plouzané, avec de fortes collaborations avec Grapheal (Grenoble), le CEA. Leti (Toulouse), le LSEM (Ifremer, Nantes), le LER-LR (Ifremer, Sète). Des déplacements ponctuels sont à prévoir vers les laboratoires partenaires.

Comment se déroulera votre activité ?

Localisation principale : LDCM/Ifremer (Plouzané), avec déplacements ponctuels possibles

Taux d’activité : 100%

Qui êtes-vous ?

- Titulaire d’une thèse de doctorat en électrochimie, chimie ou biotechnologie

- Compétences mises en œuvreThèse doit être obtenue depuis moins de trois ans (date d'embauche)

Compétences mises en œuvre :

-           Electrochimie

-           Modification de surfaces

-           Biochimie (anticorps, acides nucléiques).

-           Une expérience préalable en microbiologie et développement de biocapteurs serait un atout,

Qualités personnelles (savoir-être) :

-           Goût pour le travail expérimental et interdisciplinaire,

-           Capacité à travailler en équipe avec des partenaires académiques et industriels,

-           Autonomie, rigueur scientifique et esprit d’initiative

Quels sont nos avantages ?

- Nous avons un accord de télétravail (à partir de 6 mois d'ancienneté) et nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT et congés supra légaux.
- Nous consacrons un budget conséquent au développement des compétences, par des actions individuelles ou collectives.
- Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée des raisons d'être de l'institut (forfait mobilité durable...)