Etude du microenvironnement des lymphomes B cutanés agressifs : vers l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques // Study of the aggressive cutaneous B cell lymphoma microenvironment: towards the identification of new therapeutic targets
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ABG-137591
ADUM-68691 |
Sujet de Thèse | |
| 03/04/2026 |
Université de Bordeaux
BORDEAUX - Nouvelle Aquitaine - France
Etude du microenvironnement des lymphomes B cutanés agressifs : vers l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques // Study of the aggressive cutaneous B cell lymphoma microenvironment: towards the identification of new therapeutic targets
- Biologie
cancer, lymphome B, microenvironnement, strategies therapeutiques
cancer, B lymphoma, microenvironment, therapeutic strategies
cancer, B lymphoma, microenvironment, therapeutic strategies
Description du sujet
Le lymphome cutané diffus à grandes cellules B primitif, de type jambe (PCDBCL-LT) est un lymphome extranodal rare et agressif, avec près de 50 % des patients présentant une rechute après un traitement standard. Ceci souligne le besoin urgent de mieux comprendre la biologie du PCDBCL-LT afin de proposer des traitements plus efficaces. La biologie du PCDBCL-LT reste mal comprise, en particulier en ce qui concerne le microenvironnement tumoral (TME) spécifique de la peau. Les travaux antérieurs de notre équipe utilisant l'immunofluorescence multiplexee (mIF), des systèmes de co-cultures et des modèles de xénogreffes ont révélé une forte infiltration de macrophages et une interaction réciproque entre les cellules tumorales et les macrophages associés aux tumeurs qui favorise l'immunosuppression et la prolifération tumorale. Des études récentes sur les lymphomes ganglionnaires suggèrent que l'organisation spatiale des cellules de la niche tumorale est hautement pronostique, mais à ce jour aucune étude de ce type n'a été effectuée sur le PCDBCL-LT.
Notre hypothèse est que l'organisation spatiale au sein du microenvironnement tumoral cutané influence les programmes transcriptionnels, les interactions et fonctions des cellules avec un impact sur la survie des patients. Afin d'identifier les marqueurs d'agressivité et de récidive, nous combinerons l'immunofluorescence multiplexee, des analyses transcriptomiques sur des biopsies de patients au diagnostic et à la récidive. Des couples ligands-récepteurs spécifiques seront identifiés et validés fonctionnellement à l'aide de tests de co-culture et de stratégies d'inhibition. Enfin, des modèles sphéroïdes 3D développés par l'équipe seront utilisés pour recréer les écosystèmes du PCDBCL-LT et évaluer l'impact de la perturbation des interactions clés sur la croissance des cellules tumorales ou leur réponses aux traitements. Les résultats obtenus permettront d'établir un atlas spatial du PCDBCL-LT, la validation de couples ligand-récepteur critiques pour la physiopathologie de ce cancer et le développement de modèles 3D physiologiquement pertinents. Ces travaux pourraient révéler de nouvelles cibles thérapeutiques, avec des implications potentielles pour d'autres lymphomes agressifs à cellules B.
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Primary cutaneous diffuse large B-cell lymphoma, leg-type (PCDBCL-LT) is a rare and aggressive extranodal lymphoma with almost 50% of patients relapsing after standard therapy highlighting the urgent need for improved understanding of PCDBCL-LT biology, to propose more efficient treatments. PCDBCL-LT biology remains poorly understood, particularly regarding the skin-specific tumor microenvironment (TME). Previous work from our team using multiplex immunofluorescence (mIF), co-culture systems, and xenograft models revealed strong macrophage infiltration and a reciprocal interaction between tumor cells and tumor-associated macrophages that promotes immunosuppression and tumor proliferation. Recent studies in nodal lymphomas suggest that spatially organized cellular neighborhoods are highly prognostic, yet PCDBCL-LT has not been explored in this context.
Our project hypothesizes that spatial organization within the skin TME influences transcriptional programs, interactions, and clinical outcomes. To identify markers of aggressiveness and relapse, an we will combine multiplex immunofluorescence, transcriptomic analyses on diagnostic and relapse biopsies. Specific ligand–receptor networks will be defined and functionally validated using co-culture assays and inhibition strategies. Finally, 3D spheroid models developed in the team will be used to recreate PCDBCL-LT ecosystems and assess the impact of disrupting key interactions on tumor cell proliferation and responses to drugs. Expected results include a spatial atlas of PCDBCL-LT, identification of critical cellular neighborhoods, validation of actionable ligand–receptor pairs, and development of physiologically relevant 3D models. This work may reveal novel therapeutic targets, with potential implications for other aggressive B-cell lymphomas.
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Début de la thèse : 01/10/2025
Notre hypothèse est que l'organisation spatiale au sein du microenvironnement tumoral cutané influence les programmes transcriptionnels, les interactions et fonctions des cellules avec un impact sur la survie des patients. Afin d'identifier les marqueurs d'agressivité et de récidive, nous combinerons l'immunofluorescence multiplexee, des analyses transcriptomiques sur des biopsies de patients au diagnostic et à la récidive. Des couples ligands-récepteurs spécifiques seront identifiés et validés fonctionnellement à l'aide de tests de co-culture et de stratégies d'inhibition. Enfin, des modèles sphéroïdes 3D développés par l'équipe seront utilisés pour recréer les écosystèmes du PCDBCL-LT et évaluer l'impact de la perturbation des interactions clés sur la croissance des cellules tumorales ou leur réponses aux traitements. Les résultats obtenus permettront d'établir un atlas spatial du PCDBCL-LT, la validation de couples ligand-récepteur critiques pour la physiopathologie de ce cancer et le développement de modèles 3D physiologiquement pertinents. Ces travaux pourraient révéler de nouvelles cibles thérapeutiques, avec des implications potentielles pour d'autres lymphomes agressifs à cellules B.
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Primary cutaneous diffuse large B-cell lymphoma, leg-type (PCDBCL-LT) is a rare and aggressive extranodal lymphoma with almost 50% of patients relapsing after standard therapy highlighting the urgent need for improved understanding of PCDBCL-LT biology, to propose more efficient treatments. PCDBCL-LT biology remains poorly understood, particularly regarding the skin-specific tumor microenvironment (TME). Previous work from our team using multiplex immunofluorescence (mIF), co-culture systems, and xenograft models revealed strong macrophage infiltration and a reciprocal interaction between tumor cells and tumor-associated macrophages that promotes immunosuppression and tumor proliferation. Recent studies in nodal lymphomas suggest that spatially organized cellular neighborhoods are highly prognostic, yet PCDBCL-LT has not been explored in this context.
Our project hypothesizes that spatial organization within the skin TME influences transcriptional programs, interactions, and clinical outcomes. To identify markers of aggressiveness and relapse, an we will combine multiplex immunofluorescence, transcriptomic analyses on diagnostic and relapse biopsies. Specific ligand–receptor networks will be defined and functionally validated using co-culture assays and inhibition strategies. Finally, 3D spheroid models developed in the team will be used to recreate PCDBCL-LT ecosystems and assess the impact of disrupting key interactions on tumor cell proliferation and responses to drugs. Expected results include a spatial atlas of PCDBCL-LT, identification of critical cellular neighborhoods, validation of actionable ligand–receptor pairs, and development of physiologically relevant 3D models. This work may reveal novel therapeutic targets, with potential implications for other aggressive B-cell lymphomas.
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Début de la thèse : 01/10/2025
Nature du financement
Précisions sur le financement
Contrat doctoral libre
Présentation établissement et labo d'accueil
Université de Bordeaux
Etablissement délivrant le doctorat
Université de Bordeaux
Ecole doctorale
154 Sciences de la Vie et de la Santé
Profil du candidat
Solides compétences en biologie cellulaire et oncologie requises
Compétences en bioinformatiques et codage informatique requises
Bonne connaissance du logiciel R
Compétences en analyses d'images requises
Sens de l'organisation et rigueur indispensable
Good knowledge in cellular biology and oncology required Skills in bioinformatic analyses and coding required Good knowledge of the R software Skills in imaging analyses required Organizational skills and thoroughness essential
Good knowledge in cellular biology and oncology required Skills in bioinformatic analyses and coding required Good knowledge of the R software Skills in imaging analyses required Organizational skills and thoroughness essential
20/05/2026
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