Cohésine, adaptation cellulaire et dynamique du génome : une étude intégrée chez S. pombe // Cohesin, cellular adaptation and genome dynamics: an integrated study in S. pombe
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ABG-137594
ADUM-68709 |
Sujet de Thèse | |
| 03/04/2026 |
Université de Bordeaux
Bordeaux cedex - Nouvelle Aquitaine - France
Cohésine, adaptation cellulaire et dynamique du génome : une étude intégrée chez S. pombe // Cohesin, cellular adaptation and genome dynamics: an integrated study in S. pombe
- Biologie
Cohésine, Génome, PTM, Génétique
Cohesin, Genome, PTM, Genetic
Cohesin, Genome, PTM, Genetic
Description du sujet
L'objectif de ce projet de recherche est d'explorer les mécanismes d'adaptation cellulaire aux changements environnementaux chez la levure Schizosaccharomyces pombe. Nous faisons l'hypothèse que la réponse adaptative rapide passe en partie par des modifications post-traductionnelles (PTM) de Cohésine, un complexe essentiel à la structuration de la chromatine. Ces PTM pourraient remodeler l'architecture chromatinienne en modulant la dynamique et les fonctions de Cohésine, permettant ainsi à la cellule d'ajuster son programme transcriptionnel face aux stress.
Le projet s'articule autour d'une thèse de trois ans centrée sur :
1. L'identification systématique des PTM induites par divers stress environnementaux (stress oxydant, osmotique, thermique…).
2. La caractérisation fonctionnelle de ces modifications sur Cohésine et sur l'organisation globale de la chromatine.
3. L'étude de leurs conséquences sur la survie cellulaire et l'expression génique.
À terme, ce travail vise à fournir une compréhension approfondie des mécanismes épigénétiques et structuraux permettant aux cellules d'orchestrer une adaptation rapide au stress, et à établir une plateforme collaborative durable pour l'étude fonctionnelle des PTM.
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The objective of this research project is to explore the mechanisms of cellular adaptation to environmental changes in the yeast Schizosaccharomyces pombe. We hypothesise that rapid adaptive responses involve post-translational modifications (PTMs) of cohesin, a complex essential for chromatin structuring. These PTMs could remodel chromatin architecture by modulating the dynamics and functions of cohesin, thereby enabling the cell to adjust its transcriptional programme in response to stress.
The project is structured around a three-year thesis focusing on:
1. The systematic identification of PTMs induced by various environmental stresses (oxidative, osmotic, thermal, etc.).
2. The functional characterisation of these modifications on Cohesin and on the overall organisation of chromatin.
3. The study of their consequences on cell survival and gene expression.
Ultimately, this work aims to provide an in-depth understanding of the epigenetic and structural mechanisms that enable cells to orchestrate rapid adaptation to stress, and to establish a sustainable collaborative platform for the functional study of PTMs.
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Début de la thèse : 01/10/2026
Le projet s'articule autour d'une thèse de trois ans centrée sur :
1. L'identification systématique des PTM induites par divers stress environnementaux (stress oxydant, osmotique, thermique…).
2. La caractérisation fonctionnelle de ces modifications sur Cohésine et sur l'organisation globale de la chromatine.
3. L'étude de leurs conséquences sur la survie cellulaire et l'expression génique.
À terme, ce travail vise à fournir une compréhension approfondie des mécanismes épigénétiques et structuraux permettant aux cellules d'orchestrer une adaptation rapide au stress, et à établir une plateforme collaborative durable pour l'étude fonctionnelle des PTM.
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The objective of this research project is to explore the mechanisms of cellular adaptation to environmental changes in the yeast Schizosaccharomyces pombe. We hypothesise that rapid adaptive responses involve post-translational modifications (PTMs) of cohesin, a complex essential for chromatin structuring. These PTMs could remodel chromatin architecture by modulating the dynamics and functions of cohesin, thereby enabling the cell to adjust its transcriptional programme in response to stress.
The project is structured around a three-year thesis focusing on:
1. The systematic identification of PTMs induced by various environmental stresses (oxidative, osmotic, thermal, etc.).
2. The functional characterisation of these modifications on Cohesin and on the overall organisation of chromatin.
3. The study of their consequences on cell survival and gene expression.
Ultimately, this work aims to provide an in-depth understanding of the epigenetic and structural mechanisms that enable cells to orchestrate rapid adaptation to stress, and to establish a sustainable collaborative platform for the functional study of PTMs.
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Début de la thèse : 01/10/2026
Nature du financement
Précisions sur le financement
Financement Région
Présentation établissement et labo d'accueil
Université de Bordeaux
Etablissement délivrant le doctorat
Université de Bordeaux
Ecole doctorale
154 Sciences de la Vie et de la Santé
Profil du candidat
Maitrise de la génétique mendélienne et des techniques de biologie moléculaire.
Connaissances théoriques des technologies de ChIP, Hi-C et de spectrométrie de masse.
Connaissances théoriques du modèle d'étude S.pombe.
Intérêt pour les analyses larges échelles (genomique et protéomique)
Proficiency in Mendelian genetics and molecular biology techniques. Theoretical knowledge of ChIP, Hi-C and mass spectrometry technologies. Theoretical knowledge of the S. pombe study model. Interest in large-scale analyses (genomics and proteomics).
Proficiency in Mendelian genetics and molecular biology techniques. Theoretical knowledge of ChIP, Hi-C and mass spectrometry technologies. Theoretical knowledge of the S. pombe study model. Interest in large-scale analyses (genomics and proteomics).
20/05/2026
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