Caractérisation phénotypique et omique d'une population clonale de Vitis vinifera cv. Gewurztraminer afin d'étudier la plasticité de l'équilibre rendement/potentiel oenologique des baies en réponse à la contrainte hydrique // Phenotypic and omics characte

Le changement climatique (CC) affecte et continuera d'affecter la phénologie et la physiologie de la vigne, ce qui aura un impact sur la composition du raisin lors de la récolte et pourrait altérer la composition du vin. Il existe plusieurs moyens d'adapter la viticulture aux conditions climatiques futures et d'accroître sa résilience au CC, mais l'utilisation de la diversité intra-variétale (c'est-à-dire clonale) a potentiellement le plus faible impact sur la typicité du vin. Il est donc essentiel d'identifier des clones présentant une tolérance élevée au stress abiotiques, et notamment hydrique, avec une faible pénalité (compromis) sur le rendement et la qualité du raisin. Ce projet utilisera une population de clones du cépage Gewürztraminer (14 clones, 22 à 54 réplicats) suivie par l'Université de Trento (Italie), implantée sur une parcelle en pente, permettant, en combinaison avec une irrigation, d'imposer des régimes hydriques différenciés.

Les objectifs des travaux de thèse seront les suivants :
1. caractérisation phénotypique du comportement agronomique de la population, y compris les paramètres de croissance, la température des feuilles, l'état hydrique (discrimination du carbone 13), ainsi que le rendement et la composition des baies à la récolte, pour des régimes hydriques contrastés ;
2. micro-fermentations pour évaluer le potentiel qualitatif des vins de chaque clone ;
3. analyses omiques sur une sélection des clones les plus contrastés (n=6-8) : métabolomique des fruits et des feuilles, transcriptomique, analyse du virome libre des feuilles pour déterminer la contribution éventuelle de la diversité virale sur les phénotypes ;
4. évaluation au vignoble de l'effet du régime hydrique sur le potentiel œnologique et le profil aromatiques de baies et des vins ;
5. évaluer les mécanismes sous-jacents de la performance agronomique et œnologique des clones en fonction de leur alimentation hydrique.

Les résultats attendus sont l'identification des compromis entre la tolérance au stress, le rendement en baies et le potentiel œnologique dans l'ensemble de la population clonale, afin d'identifier les génotypes présentant une tolérance élevée au stress thermique et au déficit hydrique, mais peu pénalisants en ce qui concerne le rendement en baies et la composition à la récolte.
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Climate change (CC) affects and will continue to affect the phenology and physiology of grapevines, which will have an impact on the composition of grapes at harvest and could alter the composition of wine. There are several ways to adapt viticulture to future climatic conditions and increase its resilience to CC, but the use of intra-varietal (i.e. clonal) diversity has potentially the least impact on the typicity of wine. It is therefore essential to identify clones with high tolerance to abiotic stress, particularly water stress, with a low penalty (compromise) on yield and grape quality. This project will use a population of Gewürztraminer clones (14 clones, 22 to 54 replicates) monitored by the University of Trento (Italy), planted on a sloping plot, which, in combination with irrigation, will allow different water regimes to be imposed.

The objectives of the thesis work will be as follows:
1. phenotypic characterization of the agronomic behavior of the population, including growth parameters, leaf temperature, water status (carbon-13 discrimination), as well as yield and berry composition at harvest, for contrasting water regimes;
2. micro-fermentations to evaluate the qualitative potential of the wines from each clone;
3. Omics analyses on a selection of the most contrasting clones (n=6-8): metabolomics of fruits and leaves, transcriptomics, analysis of the free virome of leaves to determine the possible contribution of viral diversity to phenotypes;
4. Evaluation in the vineyard of the effect of water regime on the oenological potential and aromatic profile of berries and wines;
5. Evaluation of the underlying mechanisms of the agronomic and enological performance of clones according to their water supply.

The expected results are the identification of trade-offs between stress tolerance, berry yield, and oenological potential across the entire clonal population, in order to identify genotypes with high tolerance to heat stress and water deficit, but with little penalty in terms of berry yield and harvest composition.
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Début de la thèse : 01/11/2026

Financement sur programme européen

Université de Bordeaux

154 Sciences de la Vie et de la Santé

- Master en physiologie végétale ou en viticulture/œnologie, avec des connaissances en métabolisme des plantes et/ou en interaction plante-facteurs abiotiques. Une connaissance préalable du modèle vigne et du raisin serait un plus, mais n'est pas un pré-requis absolu. - Intérêt pour l'analyse de données, la lecture et rédaction d'articles scientifiques. - Une bonne maîtrise de la langue anglaise orale et écrite, niveau B2 minimum (C1 idéal). La connaissance de l'italien n'est pas exigée. - Capacité à travailler en équipe et à communiquer et de façon fluide avec ses collègues. - Capacité d'écoute et réceptivité aux conseils et suggestions.
- Master's degree in plant physiology or viticulture/oenology, with knowledge of plant metabolism and/or plant-abiotic factor interactions. Prior knowledge of the vine and grape models would be a plus, but is definitively not an absolute prerequisite. - Interest in data analysis, reading and writing scientific articles. - Good knowledge of spoken and written English, minimum level B2 (C1 ideal). Knowledge of Italian is not required (but would be a plus). - Ability to work in a team and communicate fluently with colleagues. - Ability to listen and be receptive to advice.