Click reactions for detection of alkyne-containing natural products

The project is based on the design of probes for the sensitive, rapid, and selective detection of secondary metabolites in various complex crude extracts from microorganisms. Indeed, the discovery of new Natural Products remains just as challenging when using classical purification methods, as efforts are often thwarted by the rediscovery of already known molecules.

In this project, the reactivity-based screening approach will enable the selection of a specific functional group of the Natural Product (alkyne) and leverage its intrinsic reactivity for detection. Fluorogenic click-probes, allowing the obtaining of a fluorescent signal after coupling and MS-tagged probes allowing enhanced MS detection will be developed.

The project will be in collaboration with the Museum National d’Histoire naturelle in Paris.

Various tasks will need to be carried out:

• Synthesis of new fluorogenic and MS-tagged probes to facilitate the detection.

• Screening of fungi (HPLC, MS, MS/MS, data analysis), involving the characterization of new alkyne-containing natural products.

L'institut CARMeN (anciennement laboratoire COBRA), est une unité mixte de recherche (UMR-6064) associant l’Université de Rouen Normandie, l’INSA Rouen Normandie et le CNRS. Le laboratoire est principalement localisé dans le bâtiment de l’IRCOF (Institut de recherche en chimie organique fine) à Mont-Saint-Aignan, mais il a des antennes à Evreux et sur le site du Madrillet à Saint-Etienne du Rouvray.
L’objectif scientifique global du laboratoire CARMeN est de développer des méthodes innovantes en synthèse organique, chimie analytique et modélisation moléculaire et de les appliquer à différents sous-domaines de la discipline (chimie bioorganique, chimie pharmaceutique, chimie éco-responsable, chimie des matériaux) en s’appuyant sur une équipe de recherche en analyse performante.L’objectif scientifique global du laboratoire CARMeN est de développer des méthodes innovantes en synthèse organique et de les appliquer à différents sous-domaines de la discipline (chimie bioorganique, chimie pharmaceutique, chimie éco-responsable, chimie des matériaux), en s’appuyant sur une équipe de recherche en analyse performante.

L'UMR CNRS 6064 CARMeN étant en zone à régime restrictif (ZRR), son accès est strictement réglementé et soumis   autorisation.

Un profil de chimiste organicien ou de chimiste des substances naturelles est recommandé. Titulaire d’un Master 2 avec au moins 13 de moyenne générale. 

Le(la) candidat(e) devra être motivé(e) par une approche multidisciplinaire et être intéressé(e) par les produits naturels. Une connaissance en HPLC analytique et préparative, fluorescence ou spectrométrie de masse serait un plus.

Envoyer CV, lettre de motivation, relevé de notes (M1 et M2) et adresse email de 2 personnes susceptibles de fournir une lettre de recommandation