Responsable plateforme génomique

L’Institut Imagine est un centre européen de référence dédié aux maladies génétiques, situé sur le campus de l’Hôpital Necker-Enfants Malades à Paris et affilié à l’Inserm, l’AP-HP et l’Université Paris Cité. Rassemblant 29 équipes de recherche et des plateformes technologiques de pointe, l’Institut offre un environnement unique à l’interface de la recherche fondamentale, de la médecine translationnelle et de cohortes rares de patients.

Dans ce contexte, la plateforme génomique occupe une position stratégique au cœur des projets scientifiques et translationnels de l’Institut. Elle accompagne des projets utilisant des approches variées incluant short-read et long-read sequencing, transcriptomique, méthylation, ATAC-seq, CUT&RUN, single-cell genomics et multi-omics.

La plateforme développe également une activité de R&D ambitieuse autour des technologies génomiques émergentes, notamment l’identification de mutations somatiques à l’échelle unicellulaire, l’intégration mutation/transcriptome et l’évaluation de nouvelles approches de séquençage.

La/le responsable travaillera en interaction étroite avec les équipes de recherche, les responsables d’équipes et le Bioinformatics & Data Hub afin de co-développer des projets innovants allant du design expérimental à l’interprétation biologique et clinique des données.

Missions principales

• Assurer la direction scientifique, opérationnelle et budgétaire de la plateforme
• Accompagner les chercheurs dans la conception et la coordination de projets complexes de génomique et multi-omique
• Développer une activité de R&D autour des nouvelles technologies génomiques, épigénomiques et unicellulaires
• Piloter l’implémentation et la validation de nouveaux protocoles et technologies
• Développer des interactions étroites avec les plateformes technologiques, le Bioinformatics & Data Hub ainsi que des partenaires académiques, cliniques et industriels
• Encadrer et animer une équipe de 4 à 6 personnes
• Garantir les standards de qualité, de traçabilité et de reproductibilité
• Participer au montage de projets collaboratifs et de financements nationaux et internationaux, et contribuer à l’impact scientifique de la plateforme via des projets transversaux et des publications

Profil recherché

Nous recherchons une personnalité scientifique avec une expertise forte en génomique à haut débit et un intérêt marqué pour l’innovation technologique et les approches interdisciplinaires. Une expérience en single-cell, long-read sequencing, multi-omics et épigénomique sera particulièrement appréciée.

Le poste requiert également de solides qualités managériales et relationnelles, ainsi qu’une capacité à développer des interactions fortes avec des partenaires académiques, cliniques et industriels dans un environnement scientifique international.

Qualifications

• Doctorat en biologie moléculaire, génomique, biotechnologies ou domaine équivalent
• Expertise des technologies Illumina, PacBio, Oxford Nanopore et/ou Element Biosciences
• Expérience significative en plateforme génomique ou environnement technologique équivalent
• Maîtrise de l’anglais scientifique (C1)