Paléoprotéomique pour la reconstitution de la santé individuelle et populationnelle du passé à nos jours. // Paleoproteomics for Reconstructing Individual and Population Health from Past to present.

La protéomique consiste en l'étude des protéines et de leurs fonctions au sein des systèmes biologiques. Les protéines peuvent survivre dans les restes anciens sans se dégrader. Elle fournit des informations sur les maladies, l'alimentation et l'état physiologique des individus du passé. L'ADN ancien se dégrade plus rapidement que les protéines, ce qui fait de ces dernières des biomarqueurs plus stables pour l'étude des restes anciens. L'étude de la santé passée par la paléoprotéomique peut apporter des éclairages précieux sur l'évolution des maladies, les réponses immunitaires et les adaptations biologiques au fil du temps. Comprendre les schémas pathologiques et les états de santé anciens peut aider les chercheurs à mieux interpréter l'origine, la progression et la persistance de certaines maladies modernes. Les protéines étant plus stables et ayant une durée de vie plus longue, la protéomique est particulièrement utile pour l'étude de la santé passée. Les protéines peuvent être extraites de divers matériaux biologiques tels que les os, les dents et les tissus mous conservés, fournissant ainsi des informations précieuses sur les individus et les populations du passé. Malgré son application croissante en recherche archéologique, les études se sont principalement concentrées sur l'identification et la caractérisation des protéines anciennes plutôt que sur leur application directe à la reconstitution de l'état de santé. Les recherches sur les interactions hôte-pathogène restent limitées, de même que l'exploration insuffisante des protéines liées à l'immunité. L'intégration des analyses biomoléculaires à la paléopathologie contribue à une meilleure compréhension de l'écologie des maladies anciennes, des interactions hôte-pathogène et de la dynamique de santé des populations.
L'analyse protéomique du tartre dentaire s'est révélée un outil précieux pour reconstituer les habitudes alimentaires anciennes, notamment les données de consommation des populations passées. Le tartre dentaire ancien constitue une archive biomoléculaire précieuse, préservant des informations sur l'alimentation, le microbiome et les maladies des populations anciennes.

Des études récentes ont démontré le potentiel de la paléoprotéomique pour comprendre la santé et l'état biologique des populations anciennes. Cependant, plusieurs limitations persistent: la dégradation des protéines due à des facteurs environnementaux affecte la qualité des données et la contamination par des facteurs modernes pose des problèmes d'authenticité. Des recherches ont démontré que le tartre dentaire préserve des protéines associées au microbiote buccal et aux maladies parodontales, offrant ainsi de précieuses informations sur l'état de santé des populations anciennes. La littérature existante souligne l'importance croissante de la recherche interdisciplinaire en paléoprotéomique pour la reconstitution de la santé, de l'écologie des maladies et des tendances évolutives en matière de santé dans le passé.

Objectifs:
 Analyser les marqueurs protéiques liés à la santé dans les populations humaines anciennes.
 Examiner les données protéomiques relatives aux protéines communes aux populations passées et actuelles.
 Évaluer la contribution de ces financements à la compréhension des enjeux de santé actuels.
 Étudier l'application de la paléoprotéomique en recherche bioarchéologique.
 Évaluer la préservation biomoléculaire dans les restes humains anciens.
 Explorer le potentiel du tartre dentaire comme source d'informations sur les protéines anciennes.
 Intégrer les approches théoriques et pratiques en recherche paléoprotéomique.
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Proteomics consists in the study of proteins and their functions within biological systems. Proteins can survive in ancient remains without degrading. It provides information about past individuals diseases, diet and physiological condition. Ancient DNA degrades faster than proteins, making proteins more stable biomarkers for studying ancient remains. The study of past health through paleoproteomics can provide valuable insights into evolution of diseases, immune responses and biological adaptations over time. Understanding ancient disease pattern and health conditions may help researchers better interpret the origin, progression and persistence of certain modern diseases. By studying past health can understand the modern diseases. Proteins are more stable and survive longer so proteomics becomes more useful for studying past health. Proteins can be recovered from various biological materials such as bones, teeth and preserved soft tissues providing valuable information about past individuals and population. Despite the growing application in archaeological research the studies have mostly focused on the identification and characterization of ancient proteins rather than direct application in reconstructing health status. Limited research on host pathogen interactions. Insufficient exploration of immune related proteins. Integrating biomolecular analyses with paleopathology supports a broader understanding of ancient disease ecology host pathogen interaction and population health dynamics.
Proteomic analysis of dental calculus has emerged as a valuable tool for reconstructing ancient dietary behaviour including evidence of consumption among past population. Ancient dental calculus serves as a valuable biomolecular archive preserving dietary microbial and disease related information from past population.
Recent biomolecular studies have highlighted the importance of human environment interactions in shaping health disease patterns and biological adaptations in ancient population.
Paleoproteomics enables analysis of ancient protein from bones, teeth and dental calculus used to reconstruct ancient diet, oral microbiome and species identification. Proteins are more stable than ancient DNA. Advanced techniques improve protein detection.
Recent studies have demonstrated the potential of paleoproteomics in understanding ancient human health and biological condition. However several limitations remain protein degradation due to environmental factors affects data quality and contamination from modern poses challenges in ensuring authenticity. Research has shown that dental calculus preserves proteins associated with oral microbiota and periodontal disease, providing valuable insights into ancient health conditions. Existing literature highlights the growing importance of interdisciplinary paleoproteomic research in reconstructing ancient health, disease ecology and evolutionary health trends.

Objective
 To analyse health related protein markers in past human populations.
 To examine proteomics evidence related proteins between past and present population.
 To evaluate how these funding contribute to understanding modern health issues.
 To investigate the application of paleoproteomics in bioarchaeological research.
 To evaluate biomolecular preservation in ancient human remains.
 To explore the potential of dental calculus as a source of ancient protein information.
 To integrate theoretical and practical approaches in paleoproreomic research.
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Début de la thèse : 01/10/2026

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Université Paris-Saclay GS Santé publique

570 Santé Publique

Master 2 en archéologie/anthropologie Connaissances en bioinformatique
Master 2 in archaeology/anthropology Knowledge in bioinformatics