Décrypter les interactions entre les éléments transposables et les facteurs de l'hôte // Deciphering the Interplay Between Transposable Element and Host factors

Les éléments transposables (ET) constituent une fraction importante des génomes eucaryotes et jouent un rôle majeur dans leur évolution ainsi que dans la génération de diversité biologique. Malgré les progrès considérables réalisés dans la compréhension de leur régulation, de nombreux aspects de leur intégration fonctionnelle au sein des systèmes cellulaires demeurent encore mal connus.

Cette thèse vise à étudier les processus moléculaires qui sous-tendent les interactions entre les éléments transposables et leurs organismes hôtes. Le ou la doctorant(e) explorera comment les activités dérivées des éléments transposables contribuent aux fonctions cellulaires et comment les mécanismes de régulation de l'hôte influencent le comportement et les trajectoires évolutives de ces éléments génomiques.

Le projet s'appuiera sur des approches de biologie moléculaire, génomique, génétique et biologie computationnelle afin d'aborder des questions fondamentales relatives au rôle des éléments transposables dans le fonctionnement et l'évolution des génomes. Une attention particulière sera portée à la compréhension des mécanismes moléculaires qui façonnent les relations entre éléments transposables et organismes hôtes ainsi qu'à leurs conséquences sur la régulation du génome.

Le ou la candidat(e) retenu(e) évoluera dans un environnement de recherche fortement interdisciplinaire et contribuera à un programme financé par le Conseil Européen de la Recherche (ERC) consacré à l'étude de la diversité, des fonctions et de l'importance évolutive des éléments transposables chez les eucaryotes.

Ce projet s'adresse à des candidat(e)s intéressé(e)s par la biologie des génomes, l'épigénétique, la génétique moléculaire, la bioinformatique et la biologie évolutive.
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Transposable elements (TEs) are major components of eukaryotic genomes and important contributors to genome evolution and biological diversity. Although significant progress has been made in understanding how these elements are regulated, many aspects of their functional integration within cellular systems remain poorly understood.

This PhD project aims to investigate the molecular processes that shape the interactions between transposable elements and their host organisms. The student will explore how TE-derived activities contribute to cellular functions and how host regulatory mechanisms influence the behavior and evolutionary trajectories of these genomic elements.

The project will combine approaches from molecular biology, genomics, genetics, and computational biology to address fundamental questions regarding the role of transposable elements in genome function and evolution. Particular emphasis will be placed on understanding the molecular mechanisms underlying TE-host relationships and their consequences for genome regulation.

The successful candidate will have the opportunity to develop expertise in a highly interdisciplinary research environment and will contribute to an ERC-funded research program investigating the diversity, function, and evolutionary significance of transposable elements across eukaryotes.

The project is suitable for candidates interested in genome biology, epigenetics, molecular genetics, bioinformatics, and evolutionary biology.
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Début de la thèse : 01/10/2026
WEB : https://cordis.europa.eu/project/id/101229950

Europe - ERC (European Research Council)

Université Paris-Saclay GS Biosphera - Biologie, Société, Ecologie & Environnement, Ressources, Agriculture & Alimentation

567 Sciences du Végétal : du gène à l'écosystème

Étudiant(e) de Master motivé(e) en biologie végétale, génétique, bioinformatique ou dans une discipline connexe. Une expérience préalable en analyse de données RNA-seq constitue un atout mais n'est pas indispensable. La curiosité scientifique, l'autonomie et la volonté d'acquérir des compétences en méthodes quantitatives sont essentielles.
Motivated Master's student in plant biology, genetics, bioinformatics, or related fields. Prior experience with RNA-seq analysis is a plus but not required. Curiosity and willingness to learn quantitative methods are essential.