Nutrition animale : optimisation d’un système de digestion in vitro du devenir de phytomarqueurs

Le laboratoire d'accueil, le SONAS (Substances d'Origine Naturelle et Analogues Structuraux), intégré à l'Université d'Angers, travaille depuis 1990 sur une thématique de recherche centrée sur la chimie des substances naturelles et leur valorisation. L’unité a acquis une expertise reconnue dans la recherche de (nouvelles) molécules naturelles ou synthétiques et d'intérêt biologique ainsi que dans des développements méthodologiques de nouvelles techniques d'analyse chimique. Depuis 2008, le SONAS est membre actif de la SFR QUASAV où il assure la coresponsabilité de l’axe qualité des productions végétales spécialisées et la gestion d’un des plateaux techniques mutualisés, dédié à l’analyse phytochimique (PTM Phyto).

Actuellement trois principaux projets structurent l’activité de recherche du laboratoire :

• le développement de nouveaux agents hémisynthètiques à propriétés anti-inflammatoires (ANR PRCI 2020-2023)
• la recherche d’inhibiteurs de phytopathogènes en protection alternative des cultures (Chaire industrielle, 2022-2026, et Plan France relance ANR,2022-2024)
• les additifs végétaux en nutrition animale (Labcom Feed In Tech, ANR 2017-2022, Plan France Relance ANR, 2021-2023, Thèse CIFRE 2022-2025, Thèse Tandem 2024-2027)

L’activité du laboratoire comprend également de nombreuses collaborations par projets, académiques ou privés, principalement dans le domaine pharmaceutique et dans le domaine du biocontrôle.

Parc instrumental du laboratoire (non exhaustif) : UPLC-QTOF, UPLC-UV-TSQ, HPLC-UV-DEDL, HPLC-Fluo, HPLC-préparative, CPC, RMN 400 MHz.

Description des équipes d’accueil/partenaires :

Ce stage de MASTER 2 se déroulera au sein du laboratoire commun regroupant le laboratoire universitaire SONAS et l'entreprise NorFeed, PME spécialisée dans les additifs à base de plantes pour la nutrition animale. Les deux structures sont en effet associés en Labcom (Labcom Feed InTech, labellisation ANR) depuis 2017. Les principaux axes d’étude du Labcom Feed InTech concernent la caractérisation d’additifs d’origine végétale, la mise au point des méthodes d’analyse de ces derniers et la caractérisation de leur mode d’action au sein de l’animal.

Contexte du sujet :

Dans un contexte de démédication en nutrition animale, le recours à des additifs à base d’extraits de plantes est de plus en plus utilisé, grâce aux divers métabolites spécialisés qu’ils contiennent et qui possèdent des propriétés biologiques diverses. Néanmoins, certains aspects de la supplémentation avec ces additifs botaniques restent encore très peu explorés, notamment le devenir des composés constitutifs des extraits au cours de leur passage dans les différents compartiments du tractus digestif de l’animal. L’utilisation d’outils de digestion in vitro permet d’obtenir des données essentielles sur la bioaccessibilité et la biotransformation des additifs botaniques. Ces outils de prédiction permettent de pallier l’utilisation d’essais de terrain souvent coûteux et faisant appel à des considérations éthiques. Il est cependant nécessaire que ces outils de digestion in vitro soient représentatifs du modèle in vivo.

Description du sujet :

L’objectif principal de ce stage sera de mettre en place un système de digestion in vitro adapté à la physiologie du poulet. Ce système de digestion, basé sur la méthode INFOGEST, sera adapté à partir de données obtenues sur le devenir des phytomarqueurs provenant d’un essai d’envergure réalisé en 2025 (300 poulets).  L’optimisation sera réalisée sur des analytes de deux classes chimiques (saponines et polyphénols) en modulant les conditions de digestion (incubation, activité enzymatique, etc.). La transformation de ces métabolites après digestion, sera analysée par des méthodes chromatographiques couplées (LC-DAD-MS-ELSD).

Cette proposition de stage, prévue pour l’année universitaire 2026–2027, s’adresse prioritairement à des étudiant(e)s de Master 2 disposant de bonnes connaissances en chimie analytique notamment. Des connaissances en biologie, biochimie et enzymologie sont également souhaitées.

Curiosité scientifique, rigueur, autonomie et sens de l’organisation sont recherchés.