offre de stage de Master 2 – Immunométabolisme et sepsis

Le sepsis est défini comme la réponse inflammatoire généralisée de l’organisme associée à une infection grave (péritonite, pneumonie, infection urinaire, etc.) due à une bactérie, un virus, un parasite ou un champignon. Les conséquences sont néfastes pour les fonctions vitales, la forme la plus sévère dite choc septique provoquant une mortalité très élevée en dépit des avancées de la médecine moderne. Les objectifs de l’unité de recherche sont : mieux comprendre les altérations circulatoires à l’échelle de la macro- et microcirculation, immunologiques et de la coagulation dans le sepsis ; envisager de nouveaux moyens pour explorer ces altérations ; trouver des nouveaux traitements.

L’équipe APCSᴇ est formée à la fois de vétérinaires physiologistes, anesthésistes, réanimateurs et d’un immunologiste du campus vétérinaire de VetAgro Sup mais également de médecins hospitalo-universitaires et praticiens hospitaliers des Hospices civils de Lyon. Ce travail collaboratif entre médecins et vétérinaires fait la force et l’originalité de l’équipe afin de répondre à ces questionnements scientifiques autour du sepsis. Les avancées scientifiques apportées par cette collaboration permettent non seulement de mieux prendre en charge les animaux septiques mais sont aussi transposables à l’homme ; la recherche fondamentale menée débouche sur de la recherche translationnelle : les mécanismes physiopathologiques décryptés, les explorations fonctionnelles mises au point et les nouvelles voies thérapeutiques ouvertes sont directement applicables à l’homme.

L’équipe APCSᴇ héberge une chaire scientifique travaillant sur les greffes de tissus composites afin de mettre au point une stratégie de greffe de main chez le nouveau-né avec une immunosuppression limitée dans le temps. 

Directeur de l’unité :
Bernard Allaouchiche (HCL)

Directrice adjointe et correspondante VetAgro Sup :
Céline Pouzot-Nevoret

Axes de recherche

Les activités de recherche de l’équipe visent à améliorer la compréhension de la physiopathologie du choc septique en s’appuyant sur des outils innovants d’exploration, avec pour finalité de développer de nouvelles thérapeutiques chez l’homme et l’animal.

Les objectifs des travaux de recherche de l’unité sont de mieux comprendre les altérations circulatoires à l’échelle de la macro et microcirculation, immunologiques et de la coagulation dans le sepsis et d’envisager de nouveaux moyens pour explorer ces altérations et trouver des nouveaux traitements en médecine humaine comme en médecine animale, dans une démarche de recherche translationnelle.

Nous recherchons un(e) étudiant(e) de Master 2 souhaitant réaliser un stage à partir de janvier

2027, dans le cadre d’un partenariat entre l’Université de Rennes (NuMeCan), VetAgro Sup -

l’équipe APCSe.

Le stage se déroulera au campus Villejean de l’Université de Rennes et sera co-encadré par le

Professeur Vincent Lagente (NuMeCan, Université de Rennes) et Dr.Tatiana Victoni (équipe

APCSe, VetAgro Sup).

Contexte scientifique du projet

Le sepsis est une urgence vitale caractérisée par une réponse inappropriée de l’organisme à une infection, pouvant conduire à une défaillance multiviscérale. Au-delà de l’inflammation systémique, le sepsis s’accompagne d’une profonde reprogrammation métabolique des cellules immunitaires, notamment des macrophages, qui influence leur état d’activation et leurs fonctions inflammatoires ou immunomodulatrices. Cette reprogrammation implique notamment une modification de l’équilibre entre glycolyse et phosphorylation oxydative mitochondriale, en lien avec les voies de réponse à l’hypoxie. Cependant, les mécanismes qui expliquent les différences de réponses inflammatoires et métaboliques entre les organes, en particulier le foie et le poumon, restent encore mal compris. Ce projet vise à étudier le rôle de l’axe PDK/PDH dans cette compartimentation immunométabolique et dans la plasticité des macrophages au cours du sepsis. L’objectif est de caractériser les signatures métaboliques et inflammatoires associées aux lésions hépatiques et pulmonaires, puis d’explorer les mécanismes identifiés à l’aide de modèles d’organoïdes 3D. Cette approche translationnelle, combinant un modèle porcin de choc septique et des modèles expérimentaux in vitro, permettra de mieux comprendre les liens entre reprogrammation métabolique, réponse immunitaire et dysfonctionnement des organes.

Le programme de travail comprendra notamment :

• la caractérisation des signatures immunométaboliques associées aux lésions hépatiques

et pulmonaires à partir de tissus porcins issus d’un modèle expérimental de choc

septique, les prélèvements ont déjà été réalisés ;

• la validation des mécanismes identifiés à l’aide de modèles d’organoïdes pulmonaires

et/ou hépatiques, dans des conditions d’exposition au LPS.

Ce stage permettra ainsi de travailler à l’interface entre immunologie, métabolisme, physiopathologie du sepsis et modèles expérimentaux, en mobilisant différentes approches

complémentaires.