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Caractérisation des assemblages de diatomées épiphytiques de sources de bord de route de Martinique

ABG-134662 Stage master 2 / Ingénieur 5 mois 682,51
03/12/2025
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AREBio
FORT-DE-FRANCE Territoires d'Outre-Mer France
  • Ecologie, environnement
diatomées, limnologie, bio-indication
15/01/2026

Établissement recruteur

L’Association de Recherche en Epidémiologie et en Biodiversité ( AREBio ) a été créée en 2016 avec pour objectifs de soutenir et de valoriser la recherche en sciences expérimentales et en santé, notamment la recherche en biodiversité végétale et marine et leurs applications en santé et en épidémiologie.

AREBio a bénéficié de l’agrément du Ministère MESRI de 2018 à 2020

AREBio est composée de chercheurs et d’enseignants chercheurs de différentes disciplines dont l’expertise est reconnue , qui appartiennent à des unités de recherche basées sur le pôle Martinique et des institutions du territoire :

1. Le groupe de recherche BIOSPHERES avec des enseignants-chercheurs et des chercheurs associés de l’UA-pôle Martinique, capables de faire valoir leurs compétences dans différents domaines de recherche en sciences expérimentales. Leurs projets de recherche portent sur des thématiques de priorités régionales en santé, biodiversité, plantes médicinales, environnement….

2. L’UF1441 qui fait partie des unités de recherche du CHU de Fort de France et s’intéresse à la Recherche en Cancérologie et Hématologie Registre Général des cancers de Martinique

Description

Les sources naturelles de Martinique constituent une ressource hydrique patrimoniale. Elles représentent des zones d'exutoire des nappes phréatiques, assurant la connexion hydrologique entre les aquifères souterrains et le réseau hydrographique de surface, constituant ainsi des points de surveillance privilégiés. Certaines d’entre elles sont accessibles et utilisés par la population. Ces dernières sont identifiées par l’ARS sous l’appellation « sources de bord de route ». 114 sources de bord de route ont fait l’objet d’une campagne d’analyses entre 2022 et 2023. Les résultats publiés dans l’Atlas des sources de Martinique de 2024, ont démontré que 93% des sources sont de qualité insuffisante à cause de pollution microbiologique (E. coli) et organique (pesticides). Seuls 6 sources sur 114 sont de bonne qualité. Face à cette problématique, il devient urgent de développer des outils de biomonitoring adaptés aux sources, domaine encore sous-développé comparativement aux eaux de surface. Les diatomées présentent un potentiel exceptionnel comme bio-indicateurs grâce à leur diversité taxonomique remarquable (plus de 12 000 espèces dulçaquicoles), leur sensibilité aux paramètres physico-chimiques, leur capacité d'intégration temporelle des perturbations, et l'existence de protocoles standardisés internationalement reconnus. Le projet D'Lo Lasous-Matinik adopte une approche intégrative du biofilm périphytique combinant trois axes complémentaires : l'étude des assemblages de diatomées (Axe 1), l'analyse des communautés bactériennes (Axe 2), et la caractérisation des substances polymériques extracellulaires - EPS (Axe 3). Ce stage se concentre exclusivement sur l'Axe 1, dédié à la caractérisation taxonomique et écologique des communautés de diatomées.

Objectifs du stage :

Caractériser les assemblages de diatomées épiphytiques de 18 sources de bord de route présentant un gradient de pollution et identifier des espèces bio-indicatrices.

Activités principales du stage :

  • Réaliser l'analyse taxonomique complète des communautés de diatomées sur substrats artificiels (18 sites)
  • Analyser les relations entre structure des communautés et gradient + paramètres physico-chimiques
  • Identifier les espèces indicatrices de sources non polluées vs fortement polluées
  • Caractériser les traits fonctionnels des assemblages (guildes écologiques, formes de vie, classes de taille)

 

Profil

Niveau attendu: 

Master 2 en Écologie aquatique / Hydrobiologie

Compétences requises :

  • Compétences en biostatistiques
  • Capacité de synthèse bibliographique et rédaction scientifiques
  • Maîtrise de la microscopie optique

Prise de fonction

02/02/2026
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