Etude du rôle des vésicules extracellulaires dans la physiopathologie du neuropaludisme

Ce projet de thèse de doctorat en sciences vise à étudier comment les vésicules extracellulaires (EVs) dérivées de patients atteints de paludisme contribuent à l’altération endothéliale et à la pathogenèse du neuropaludisme.

La recherche comporte deux objectifs principaux :

Objectif 1 : Caractérisation moléculaire du contenu des EVs provenant de patients atteints de paludisme
Le/la candidat(e) analysera le contenu moléculaire (protéines et micro-ARN) des EVs isolées à partir du plasma de patients.

Objectif 2 : Étudier les mécanismes du dysfonctionnement endothéliale induit par les EVs
Cet objectif a pour but de déterminer comment les EVs dérivées des patients affectent l'intégrité de l'endothélium cérébral et quels composants issus de EVs sont responsables de cette altération.

Techniques et méthodes utilisées :
- Analyse protéomique : LC-MS/MS sans marquage pour une haute sensibilité et précision.
- Profilage des miARN : Carte TaqMan® Array Human miRNA et qRT-PCR pour quantifier
377 miARNs, en s'appuyant sur des résultats préliminaires.
- Essais fonctionnels : Évaluation de l’inactivation génique médiée par RISC pour tester la
fonctionnalité des miARN candidats, imagerie en temps réel et cytométrie en flux pour suivre
les interactions EV-cellule, analyse différentielle de l’expression génique pour identifier les
réponses moléculaires des cellules endothéliales aux EVs dérivées de patients, validation
fonctionnelle des miARN candidats.

Vous aurez l’opportunité de :
- Rejoindre une équipe pluridisciplinaire à la pointe de la recherche sur le paludisme et la biologie
vasculaire
- Accéder à des technologies de pointe et des protocoles optimisés pour l’analyse des vésicules
extracellulaires et des données omiques
-  Contribuer à une recherche ayant un fort impact clinique et translationnel
- Bénéficier d’un soutien important pour le développement de compétences, et la diffusion
scientifique

Projet collaboratif à l'interface de deux laboratoires :

UMR MERIT Santé internationale de la Mère et de l'enfant IRD, Faculté de pharmacie/Université Paris Cité, 4 avenue de l'Observatoire, 75006 Paris . https://umr-merit.ird.fr/equipe/brouillon-auto-16/

et Institut Cochin, Equipe de Biologie vasculaire dans l’infection, l’inflammation et le cancer, 22 rue Méchain 75014 Paris. https://institutcochin.fr/equipes/biologie-cellules-vasculaires-dans-linfection-linflammation-cancer

Direction/ Encadrement : Rachida TAHAR (MERIT) et Sandrine BOURDOULOUS (Institut Cochin)

- Master 2 en Biologie Moléculaire, Biologie Cellulaire, Biochimie ou Microbiologie (une connaissance
préalable de la biologie de l’endothélium, de l’inflammation ou des systèmes neurovasculaires
serait un plus)

-Expérience démontrée en techniques de biologie moléculaire et cellulaire (cultures cellulaires,
cytométrie en flux, microscopie à fluorescence, qPCR ou transfections d’ARN).

- Familiarité avec les approches d’analyse omiques (transcriptomique, protéomique ou
miRnomique)

- Solides compétences analytiques et organisationnelles

- Bon niveau d’anglais