Identification des facteurs pouvant impacter le développement des embryons porcins produits in vitro

Environnement de travail :

Ce stage s’inscrit dans le cadre d’une thèse d’université Cifre (2024-2027) portée conjointement par l’entreprise AXIOM[1] et VetAgro Sup – Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon[2]. La société AXIOM est un acteur mondial de la diffusion de la génétique porcine française ; VetAgro Sup est un établissement d’enseignement supérieur et de recherche.

Le stage se déroulera au sein de l’unité ICE ‘Interactions Cellules Environnement’ (UPSP 2021.A104) située sur le campus vétérinaire de VetAgro Sup (1 avenue Bourgelat 69280 Marcy-l’Etoile, Rhône-Alpes, France). Le campus accueille en périphérie de Lyon près de 1000 étudiants vétérinaires, une centaine d’enseignants-chercheurs et près de 350 personnels d’appui à la recherche. L’unité ICE regroupe sur le campus une quarantaine d’enseignants-chercheurs cliniciens et d’ingénieurs et dispose de locaux spécifiquement dédiés à son activité, notamment un plateau de culture cellulaire de ~200m², un laboratoire de cryobiologie, et l’ensemble des équipements de caractérisation des ressources biologiques (microscopie, analyse d’images, biologie moléculaire, …).

Contexte du stage :

La filière porcine est menacée par l’émergence permanente de nouvelles maladies, pouvant devenir préoccupantes. Dans ce contexte, une banque de semence porcine a été mis en place il y a plusieurs années au sein de la Cryobanque Nationale (Cf. Projet PIA CRB-Anim, ANR 11-INBS-0003), mais la reconstitution d’une race en danger ou d’une lignée génétique spécifique nécessite de pouvoir disposer d’embryons ou d’ovocytes cryoconservés. Il est donc nécessaire pour les opérateurs de la filière porcine de disposer d’un protocole permettant la conservation des races en cas d’apparition de foyers infectieux en faune sauvage ou dans les élevages de production. La mise en place d’une cryobanque d’embryons chez les porcins permettrait également la sauvegarde des races locales à faible effectif, en situation critique.

La maturation ovocytaire et la fécondation in vitro (FIV) sont largement utilisées à travers le monde, tant chez les animaux d’élevage que chez l’humain. Peu fructueuses initialement, les techniques de FIV se sont raffinées au fil des années et permettent aujourd’hui d’obtenir de bons taux d’embryons chez plusieurs espèces. Cependant, chez le porc, les taux de réussite restent relativement faibles et très variables.

Description du projet :

C’est dans ce contexte que s’inscrit ce projet de stage : vous accompagnerez une équipe dont l’objectif scientifique est notamment de caractériser et d’étudier l’interaction des facteurs qui compromettent aujourd’hui la production in vitro d’embryons porcins, et leur cryoconservation. La levée des verrous identifiés devrait ainsi permettre au partenaire industriel et aux différents acteurs de la filière porcine de consolider une cryobanque d’embryons transférables dans des mères porteuses, quel que soit la lignée ou la race d’origine.

Techniques mises en oeuvre au cours du stage :

Ponction folliculaire, maturation in vitro d’ovocytes, fécondation in vitro, développement embryonnaire, marquage fluorescent et microscopie confocale, analyses CASA (Computer Assisted Sperm Analysis), cytométrie en flux, statistiques.

Master 2 recherche en biologie, avec un intérêt plus particulier pour la biologie de la reproduction, l’embryologie et/ou les techniques d’analyses des spermatozoïdes.

Bonne capacité d’analyse et de synthèse, esprit critique. Maitrise des techniques de base de laboratoire (ex : pipetage) appréciée. Compte tenu de l’emplacement géographique du campus vétérinaire, être véhiculé sera plus confortable pour le candidat. Candidat dynamisme, proactif et motivé.

Pour les étudiants d'un master français : Maitrise du français (écrit et oral) et compréhension de l’anglais écrit.

Pour les étudiants étrangers : Maitrise de l'anglais (écrit et oral) .