Développement d'une Méthode de détection des produits aquatiques congelés/décongelésgélation/décongélation des produits aquatiques

Les personnels de l’ULCO se répartissant au sein des équipes 8 et 9 de l’UMRt BioEcoAgro.

Ils travaillent en lien avec l’Anses via une unité sous contrat avec le Laboratoire de Sécurité des Aliments (LSA) localisé à Maisons-Alfort et Boulogne sur mer. Voir l’organigramme de l’unité ici.

Les enseignants-chercheurs de l’ULCO travaillent sur :

la qualité et la fraîcheur des produits aquatiques au sein de l’équipe 9 du pôle 3 de l’UMRt BioEcoAgro,

le risque sanitaire lié aux vibrions potentiellement entéro-pathogènes dans les produits de la mer et dans les prélèvements environnementaux au sein de l’équipe 8 du pôle 3 de de l’UMRt BioEcoAgro,

Dans ce cadre :

ils développent une recherche universitaire correspondant aux axes stratégiques de l’ULCO par le biais du programme scientifique du Campus de la mer et qui s’est concrétisé par les programmes de recherches des Contrats Plan État Région (CPER)  intitulés MARCO (2015-2019) et IDEAL (2021-2027) (vidéo ici).

ils travaillent en complémentarité avec l’Anses Boulogne-sur-Mer pour les sujets portant sur les risques biochimiques et microbiologiques liés aux produits aquatiques,

ils intègrent la problématique des industriels de la filière pêche via le pôle Aquimer et sa feuille de route stratégique.

La consommation mondiale de poissons connaît une croissance constante, mais la fraude alimentaire, notamment la vente de produits décongelés présentés comme frais, représente un enjeu majeur pour la sécurité sanitaire et la confiance des consommateurs. Les méthodes actuelles d’évaluation de la fraîcheur reposent souvent sur des observations visuelles ou des analyses coûteuses, ce qui souligne la nécessité de développer des outils plus rapides et fiables. Ce stage, proposé au sein de l’UMRT BioEcoAgro à Boulogne-sur-Mer, s’inscrit dans un projet visant à identifier des marqueurs moléculaires de fraîcheur des produits aquatiques et à développer une méthode de détection basée sur la qPCR (PCR quantitative en temps réel). Des travaux préliminaires ont mis en évidence l’ADN mitochondrial (ADNmt) comme biomarqueur prometteur, sa libération augmentant significativement après congélation/décongélation en raison d’une altération des membranes mitochondriales. Dans ce contexte, le/la stagiaire aura pour mission de développer et d’optimiser une méthode qPCR ciblant les gènes mitochondriaux 16S et Cytb, de standardiser une approche comparative entre l’ADNmt libéré dans les exsudats et l’ADNmt total des tissus, et de tester plusieurs espèces de poissons (daurade, saumon, bar, lieu noir). Il/elle sera responsable de la collecte des exsudats à partir de filets frais ou congelés, de l’analyse par qPCR pour quantifier l’ADNmt et de l’optimisation des amorces ainsi que des paramètres expérimentaux afin d’obtenir une méthode robuste et reproductible. Les retombées scientifiques attendues concernent une meilleure compréhension des mécanismes cellulaires liés à la conservation des produits aquatiques. Sur le plan économique, le développement d’une telle méthode de biologie moléculaire viendrait compléter le kit de détection rapide et renforcer le partenariat avec les entreprises de la filière halieutique.

Connaissances théoriques et pratiques en biologie moléculaire, PCR, qPCR, extraction ADN

Intérêt pour la recherche appliquée